15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1565 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0136  hypothetical protein  94.9 
 
 		 353 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1565  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  731    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0247556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1276  hypothetical protein  95.36 
 
 		 302 aa  565  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0779925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3348  hypothetical protein  44.17 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2767  hypothetical protein  41.22 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2363  hypothetical protein  41.72 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0930  hypothetical protein  32.7 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2383  hypothetical protein  33.61 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0299642  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3310  hypothetical protein  32.35 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.511384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6014  hypothetical protein  33.09 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3612  hypothetical protein  40 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3352  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.197712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1745  hypothetical protein  30.07 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2074  hypothetical protein  42.68 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2457  hypothetical protein  32.38 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>