16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1152 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1152  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  835    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.303869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1931  hypothetical protein  53.28 
 
 
258 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0476094  hitchhiker  0.0000000997177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2402  hypothetical protein  47.01 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  50.79 
 
 
274 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1231  hypothetical protein  52.33 
 
 
293 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.446954  normal  0.253357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2457  hypothetical protein  43.96 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5241  hypothetical protein  47.95 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3052  hypothetical protein  36.99 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.833159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  37.37 
 
 
315 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  100 
 
 
320 aa  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  100 
 
 
295 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  95 
 
 
321 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3267  DnaD domain protein  27.69 
 
 
254 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>