28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1775 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  100 
 
 
321 aa  670    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  94.7 
 
 
339 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  94.7 
 
 
321 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  95.07 
 
 
304 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  63.64 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  60.3 
 
 
295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  60.3 
 
 
320 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  46.24 
 
 
313 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2616  hypothetical protein  46.48 
 
 
306 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00545088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  50.5 
 
 
430 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3450  hypothetical protein  41.82 
 
 
254 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2249  hypothetical protein  40.14 
 
 
354 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1014  phage replication protein O domain-containing protein  34.9 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  unclonable  0.00000357424 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10024  DNA replication protein  33.78 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.222522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00721  hypothetical protein  33.78 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.180512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3553  replication protein O  33.78 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.609117  hitchhiker  1.07069e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3819  hypothetical protein  38.65 
 
 
252 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3535  hypothetical protein  38.65 
 
 
252 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3455  hypothetical protein  46.53 
 
 
252 aa  95.9  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2985  prophage LambdaSo, replication protein O  39.62 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1600  replication protein O  32.12 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3234  phage replication protein O  32.12 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.69672  hitchhiker  0.00032454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2617  phage replication protein O  37.38 
 
 
355 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.398794  hitchhiker  0.0000603764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1119  replication protein O  39.25 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.807311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2245  hypothetical protein  36.23 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000488792  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5817  hypothetical protein  40.45 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0089  hypothetical protein  29.93 
 
 
367 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0984829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1152  hypothetical protein  95 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.303869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>