59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1474 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  75.2 
 
 		 1157 aa  1605    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  96.54 
 
 		 1159 aa  2036    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  97.04 
 
 		 1159 aa  2042    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  81.62 
 
 		 1132 aa  1697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 1012 aa  2097    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  62.23 
 
 		 1116 aa  1138    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  72.32 
 
 		 1120 aa  1340    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  63.03 
 
 		 1116 aa  1157    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  72.78 
 
 		 1120 aa  1344    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  80.43 
 
 		 1137 aa  1669    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  83.79 
 
 		 1157 aa  1787    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  84.37 
 
 		 1132 aa  1763    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  85.52 
 
 		 951 aa  1144    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  85.47 
 
 		 1158 aa  1819    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  67.81 
 
 		 837 aa  1182    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  70.5 
 
 		 1159 aa  1506    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  70.6 
 
 		 1159 aa  1507    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  83.7 
 
 		 1157 aa  1783    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  85.47 
 
 		 1158 aa  1819    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  81.62 
 
 		 1132 aa  1697    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  96.82 
 
 		 881 aa  1767    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  79.55 
 
 		 522 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  35.13 
 
 		 1059 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5540  fibronectin type III domain protein  96.77 
 
 		 217 aa  436  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  34.74 
 
 		 1051 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1100 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  32.03 
 
 		 1101 aa  365  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1092 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  34.47 
 
 		 1133 aa  360  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.42 
 
 		 1221 aa  344  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  33.2 
 
 		 1219 aa  343  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  30.7 
 
 		 1067 aa  335  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  37.48 
 
 		 3238 aa  332  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  37.67 
 
 		 3286 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  30.47 
 
 		 1543 aa  326  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  36.8 
 
 		 3521 aa  326  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  36.46 
 
 		 2900 aa  324  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  36.88 
 
 		 2899 aa  322  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  36.46 
 
 		 2140 aa  317  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  36.01 
 
 		 3006 aa  317  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  29.45 
 
 		 1061 aa  315  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  39.78 
 
 		 1103 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  32.04 
 
 		 1816 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  31.49 
 
 		 1341 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  30.19 
 
 		 1188 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  31.6 
 
 		 1194 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  30 
 
 		 2007 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  37.38 
 
 		 1057 aa  270  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  25.99 
 
 		 960 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  24.81 
 
 		 1644 aa  94.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  40.4 
 
 		 1093 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  40.4 
 
 		 1093 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1830 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00838  hypothetical protein  24.52 
 
 		 779 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  27.45 
 
 		 934 aa  51.6  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  27.47 
 
 		 2400 aa  46.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  20.31 
 
 		 918 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  18.44 
 
 		 1171 aa  45.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  45.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>