More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2658 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
296 aa  607  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 
296 aa  607  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  56.75 
 
 
293 aa  359  4e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  35.81 
 
 
328 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.15 
 
 
318 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.81 
 
 
307 aa  198  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78714e-14 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  36.15 
 
 
307 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  35.81 
 
 
307 aa  197  1e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.81 
 
 
305 aa  197  2e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.81 
 
 
320 aa  197  2e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.81 
 
 
307 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  35.93 
 
 
310 aa  196  4e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.15 
 
 
307 aa  195  8e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.23465e-05 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.15 
 
 
307 aa  195  8e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  32.76 
 
 
308 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  31.29 
 
 
311 aa  129  4e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  29.86 
 
 
308 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  29.86 
 
 
308 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 
313 aa  127  2e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  27.1 
 
 
327 aa  121  2e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  27.65 
 
 
624 aa  118  1e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  26.19 
 
 
640 aa  118  2e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  30.25 
 
 
316 aa  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.25 
 
 
316 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.25 
 
 
316 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.25 
 
 
319 aa  112  7e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30.25 
 
 
319 aa  112  7e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 
320 aa  112  1e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.75 
 
 
316 aa  110  2e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  29.81 
 
 
322 aa  110  2e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  35.05 
 
 
379 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  26.3 
 
 
349 aa  110  4e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  29.62 
 
 
316 aa  110  4e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  29.77 
 
 
324 aa  110  4e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.3 
 
 
316 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.3 
 
 
316 aa  109  7e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  24.92 
 
 
362 aa  108  7e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.52 
 
 
316 aa  108  9e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  32.26 
 
 
420 aa  108  9e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  29.97 
 
 
394 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 
336 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  26.17 
 
 
596 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  33.64 
 
 
352 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  29.49 
 
 
396 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4503  putative cobalamin synthesis protein/P47K  31.34 
 
 
438 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0005  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.68 
 
 
519 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3934  cobalamin synthesis protein P47K  31.34 
 
 
438 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  32.04 
 
 
400 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  26.03 
 
 
341 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 
400 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  29.36 
 
 
423 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0005  CobW/P47K family protein  29.68 
 
 
446 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 
407 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  29.36 
 
 
423 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  31.48 
 
 
400 aa  103  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  29.36 
 
 
402 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0005  CobW/P47K family protein  30.14 
 
 
446 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3520  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.14 
 
 
446 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1893  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.14 
 
 
446 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  24.92 
 
 
341 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0218  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.14 
 
 
446 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2789  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.14 
 
 
446 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0635224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  30.28 
 
 
402 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  33.16 
 
 
346 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  25 
 
 
344 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  29.95 
 
 
400 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  33.16 
 
 
346 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  32.31 
 
 
364 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  36.81 
 
 
344 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  25.86 
 
 
308 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  29.36 
 
 
423 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  27.24 
 
 
303 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  28.12 
 
 
339 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  27.12 
 
 
318 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  35.52 
 
 
324 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4536  cobalamin synthesis protein, P47K  28.31 
 
 
401 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  25.39 
 
 
342 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  25.79 
 
 
394 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  33.17 
 
 
353 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  30.73 
 
 
401 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  23.65 
 
 
614 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3705  cobalamin synthesis protein P47K  27.6 
 
 
435 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  29.68 
 
 
470 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0064  cobalamin synthesis protein, P47K  29.68 
 
 
437 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0083  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 
437 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  30.14 
 
 
441 aa  99.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3382  cobalamin synthesis protein P47K  27.6 
 
 
435 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  30.59 
 
 
380 aa  99.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  35.36 
 
 
366 aa  99.4  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  3.43665e-05 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  30.32 
 
 
424 aa  99  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  25.08 
 
 
625 aa  99  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  31.25 
 
 
379 aa  99  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  29.68 
 
 
436 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  31.25 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  29.68 
 
 
437 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  31.12 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3649  cobalamin synthesis protein P47K  29.36 
 
 
423 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493761  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  29.68 
 
 
436 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  29.52 
 
 
433 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  30.8 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>