298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2493 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  56.99 
 
 		 181 aa  199  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  55.74 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  48.68 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  48.48 
 
 		 204 aa  141  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  48.48 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  48.47 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  48.21 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  46.58 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  46.75 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  46.15 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  44.44 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  46.43 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  44.79 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  45.24 
 
 		 219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  45.24 
 
 		 219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  47.02 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  43.86 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  45.24 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  45.83 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  45.88 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  45.12 
 
 		 253 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  42.11 
 
 		 259 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  40.72 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  41.32 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  43.71 
 
 		 204 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  44.44 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  44.44 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  40.61 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  44.64 
 
 		 286 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  44.31 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  41.72 
 
 		 178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  44.19 
 
 		 263 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  41.76 
 
 		 279 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  38.82 
 
 		 225 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  41.52 
 
 		 255 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  40.24 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  42.59 
 
 		 260 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  41.82 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  40.36 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  38.64 
 
 		 314 aa  92  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  33.12 
 
 		 151 aa  86.7  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  35.67 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  36.62 
 
 		 152 aa  84.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  35.62 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  33.99 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  31.87 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  35.26 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  32.9 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  33.54 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  36.13 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  34.16 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  36.13 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  30.13 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  31.68 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  36.03 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  34.13 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  31.85 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  32.68 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  33.8 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  31.25 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  35.48 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  32.24 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  33.8 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  31.79 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  36.65 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  39.47 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  36.69 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  32.7 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  31.61 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  31.61 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  31.61 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  32.92 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  31.61 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  31.69 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  34.06 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  35.37 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  33.13 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  30.28 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  30.28 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  29.94 
 
 		 158 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  35.37 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  30.28 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  33.54 
 
 		 159 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  31.69 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  31.61 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  28.57 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  32.39 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  32.39 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  31.41 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  33.54 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>