129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1082 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  100 
 
 
330 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 
323 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  31.27 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
320 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  31.63 
 
 
331 aa  125  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  31.31 
 
 
331 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
315 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
337 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  30.32 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  32.48 
 
 
315 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  31.61 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  30.41 
 
 
324 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  34.3 
 
 
330 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 
330 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
345 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
329 aa  109  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
329 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  27.52 
 
 
322 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
324 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
329 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  30.25 
 
 
332 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 
333 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  29.83 
 
 
338 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  29.83 
 
 
338 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  29.83 
 
 
338 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  29.83 
 
 
338 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  29.83 
 
 
338 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  31.01 
 
 
330 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  30.86 
 
 
340 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  30.86 
 
 
340 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  30.86 
 
 
340 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  30.86 
 
 
340 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  30.86 
 
 
340 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  30.86 
 
 
340 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  30.86 
 
 
340 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  30.86 
 
 
340 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  30.86 
 
 
340 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 
315 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
317 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  30.59 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  31.71 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  27.96 
 
 
320 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  25.83 
 
 
322 aa  96.7  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  28.06 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  28.94 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
327 aa  94  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  29.74 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  27.8 
 
 
333 aa  93.6  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 
327 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
327 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
327 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
347 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
314 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  29.08 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  29.35 
 
 
345 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 
300 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  27.6 
 
 
329 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  28.27 
 
 
331 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  31.74 
 
 
355 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
302 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  25.27 
 
 
318 aa  85.9  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  29.53 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  27.59 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  27.27 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  25.27 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  28.39 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  25.55 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  25.91 
 
 
638 aa  79.7  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  23.76 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  23.08 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  23.08 
 
 
267 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  23.08 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  23.49 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  23.08 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  23.05 
 
 
267 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  23.08 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  26.98 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  23.13 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  23.08 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  23.13 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 
267 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
313 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>