273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0988 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  76.96 
 
 		 190 aa  298  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  74.36 
 
 		 192 aa  294  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  60 
 
 		 189 aa  231  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  57.59 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  59.47 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  56.77 
 
 		 188 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  56.77 
 
 		 187 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  55.21 
 
 		 192 aa  216  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  57.37 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  56.77 
 
 		 188 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  56.77 
 
 		 188 aa  215  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  56.77 
 
 		 188 aa  214  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  56.77 
 
 		 188 aa  214  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  56.02 
 
 		 187 aa  214  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  57.14 
 
 		 190 aa  214  8e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  56.54 
 
 		 190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  57.14 
 
 		 188 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  54.97 
 
 		 186 aa  211  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  54.21 
 
 		 187 aa  211  7e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  54.21 
 
 		 186 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  54.45 
 
 		 189 aa  210  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  54.69 
 
 		 188 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  56.25 
 
 		 187 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  57.07 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  57.07 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  53.89 
 
 		 187 aa  205  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  60 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  54.21 
 
 		 187 aa  204  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  56.59 
 
 		 188 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  56.59 
 
 		 188 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  54.21 
 
 		 186 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  53.4 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  54.64 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  56.77 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  52.33 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  53.16 
 
 		 186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  49.74 
 
 		 183 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  53.93 
 
 		 187 aa  187  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  55.56 
 
 		 187 aa  180  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  47.15 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  42.49 
 
 		 191 aa  176  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  42.63 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  44.9 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  49.74 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  42.21 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  42 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  40.31 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  40.51 
 
 		 254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  41.84 
 
 		 242 aa  151  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  41.09 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.58 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.5 
 
 		 198 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  38.1 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.5 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  34.04 
 
 		 305 aa  117  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.5 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  36.72 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.09 
 
 		 299 aa  98.6  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  30.32 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  29.63 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.54 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.18 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  47.95 
 
 		 80 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  47.95 
 
 		 80 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  48.57 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.39 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.33 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  49.28 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.54 
 
 		 74 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  47.89 
 
 		 74 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  43.94 
 
 		 80 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  54.84 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  42.31 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.85 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.15 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  54.84 
 
 		 72 aa  62  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  50.85 
 
 		 78 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 		 78 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  50.85 
 
 		 78 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  50.85 
 
 		 78 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  50.85 
 
 		 78 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  48.28 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  53.23 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  48.28 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  48.28 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  48.28 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  41.33 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  45.9 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  46.48 
 
 		 74 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  40.58 
 
 		 76 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  45.07 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  48.28 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  50 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>