More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2402 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  100 
 
 
333 aa  633  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  53.97 
 
 
317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  54.33 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  54 
 
 
317 aa  299  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  53.12 
 
 
344 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  50.45 
 
 
331 aa  275  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  52.53 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  49.67 
 
 
335 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  44.63 
 
 
335 aa  249  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  44.63 
 
 
335 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  44.63 
 
 
335 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  44.07 
 
 
332 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  51.57 
 
 
345 aa  248  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  38.44 
 
 
323 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  48.97 
 
 
319 aa  242  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  55.25 
 
 
326 aa  238  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  44.55 
 
 
335 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  43.9 
 
 
335 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  41.14 
 
 
369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  37.81 
 
 
317 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  39.06 
 
 
336 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  47.6 
 
 
314 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  42.53 
 
 
318 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  42.53 
 
 
318 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  37.06 
 
 
312 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  37.06 
 
 
312 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  44.48 
 
 
344 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  38.85 
 
 
316 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 
316 aa  202  6e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  36.86 
 
 
316 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  42.67 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  40.14 
 
 
350 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 
324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  43.49 
 
 
316 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  38.94 
 
 
355 aa  192  8e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  35.99 
 
 
316 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  36.88 
 
 
322 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  36.79 
 
 
333 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  32.84 
 
 
352 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  42.81 
 
 
314 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  43.14 
 
 
314 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  39.58 
 
 
356 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  32.51 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  39.5 
 
 
362 aa  179  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 
354 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  33.57 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  33.57 
 
 
354 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  33.57 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  36.36 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  33.57 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  38.33 
 
 
366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
354 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.23 
 
 
322 aa  155  8e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  28.96 
 
 
317 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  33.44 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  33.21 
 
 
354 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  33.11 
 
 
316 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  34.39 
 
 
301 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  26.75 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  29.5 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  28.12 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  27.74 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  24.66 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  28.21 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  25.08 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  26.28 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  30.16 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0134  transport system permease protein  31.56 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 
335 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  25.25 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  26.09 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  27.21 
 
 
315 aa  67  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  22.97 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  25.25 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  27.55 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  26.62 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  26.36 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  30.71 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  23.3 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  28.03 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  28.03 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 
343 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  25.5 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  25.5 
 
 
335 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  25.39 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  27.24 
 
 
672 aa  63.2  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  26.69 
 
 
337 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  29.9 
 
 
333 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  26.69 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  27.39 
 
 
694 aa  62.8  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  25.09 
 
 
335 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  28.72 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  30.84 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>