251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2630 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 
198 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  61.36 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  58.76 
 
 
201 aa  209  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  53.37 
 
 
203 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  55.9 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  42.35 
 
 
213 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  46.77 
 
 
203 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  41.3 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  46.24 
 
 
242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  39.39 
 
 
203 aa  143  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  45.3 
 
 
204 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  44.12 
 
 
216 aa  138  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  41.34 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  39.77 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  35.14 
 
 
212 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  31.68 
 
 
204 aa  99  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  34.48 
 
 
223 aa  91.7  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  33.14 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  30.92 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  35.36 
 
 
211 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  36.75 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  35.52 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  32.43 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  33.52 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  32.35 
 
 
219 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  35.33 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  33.7 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.36 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  35.22 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  31.95 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  31.68 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  32.78 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  35.09 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  34.38 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  33.92 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  42.98 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  35.03 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  34.04 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  35.03 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  34.08 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.28 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  31.69 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  35.12 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  35.12 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  34.71 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  31.69 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  34.39 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  33.91 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  33.52 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  36 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  32.39 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  31.61 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  36.36 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  44.44 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  30.54 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  32.66 
 
 
255 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  32.39 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  32.54 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  39.13 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  41.9 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.74 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1485  arylesterase  33.93 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3005  Lysophospholipase  31.58 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  32.39 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  30.41 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.65 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.58 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.9 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.24 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  40.19 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  29.34 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  30.29 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  28.8 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  28.8 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  28.8 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  28.8 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  29.34 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  28.8 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.65 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  32.96 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  39.25 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.34 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  29.65 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  31.96 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  30.29 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.86 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  31.58 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  34.46 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3193  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.76 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.194164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  30.51 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.77 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  32.09 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  40 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>