More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2509 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
208 aa  425  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.8 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.3 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 
209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 
209 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.27 
 
 
210 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.27 
 
 
210 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.27 
 
 
210 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 
211 aa  121  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  34.67 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  37.76 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.81 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.09 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  35.21 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.01 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.03 
 
 
205 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 
205 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  34.33 
 
 
183 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 
205 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  34.52 
 
 
205 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  34 
 
 
186 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  34 
 
 
186 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  36.54 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  33.96 
 
 
236 aa  94.7  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  37.02 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4895  Glutathione S-transferase domain  35.32 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.123273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  34.83 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  34.98 
 
 
222 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  35.86 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  29.65 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1679  Glutathione S-transferase domain protein  34.02 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000555439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  33.82 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  34.1 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  33.82 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.43 
 
 
222 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2021  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.02 
 
 
222 aa  87.8  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948185  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2536  glutathione S-transferase family protein  32.66 
 
 
207 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.869863  normal  0.0380869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 
200 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  34.02 
 
 
209 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1576  glutathione S-transferase family protein  33.53 
 
 
222 aa  87  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1393  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
222 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1416  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2966  Glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 
222 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183097  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.21 
 
 
213 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  32.84 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  35.15 
 
 
215 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.53 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  33.17 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2741  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.492964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1306  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.09 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3856  glutathione S-transferase family protein  29.76 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  28.57 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  31.71 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.72 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1629  glutathione S-transferase  29.52 
 
 
207 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.197221  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1775  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3352  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148422  hitchhiker  0.0000403309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1377  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
222 aa  85.1  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.682685  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  33.83 
 
 
210 aa  84.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  34.02 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  30.24 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4710  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.78 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131353  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  29.76 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  29.49 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0805  putative glutathione S-transferase  28.09 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1946  Glutathione S-transferase domain protein  31.28 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.243361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0277  Glutathione S-transferase domain  30.89 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562576  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2218  Glutathione S-transferase domain  34.72 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1077  Glutathione S-transferase domain protein  33.5 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147439  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  30.99 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.35 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5781  Glutathione S-transferase domain protein  33.16 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  33.13 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0966  glutathione S-transferase family protein  33.33 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2747  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2665  putative glutathione S-transferase  33.49 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1542  putative glutathione S-transferase  33.49 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0898  glutathione S-transferase family protein  34.3 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  34.2 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  33.98 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  32.84 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3730  glutathione S-transferase-like  31 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.15 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>