More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0096 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  100 
 
 
103 aa  215  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  71.57 
 
 
101 aa  153  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  71.57 
 
 
101 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  3.72785e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  71.57 
 
 
101 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  71.57 
 
 
101 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  68.63 
 
 
102 aa  152  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  70.87 
 
 
102 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  71.57 
 
 
101 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  71.57 
 
 
101 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  71.57 
 
 
123 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  71.57 
 
 
101 aa  151  3e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.17215e-06  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  70.59 
 
 
101 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  68.63 
 
 
102 aa  150  6e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.90475e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  67.65 
 
 
102 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  70.3 
 
 
101 aa  145  1e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  63.64 
 
 
102 aa  138  2e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  1.04645e-08 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  52.43 
 
 
106 aa  113  9e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.71125e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  55.88 
 
 
103 aa  110  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  48.08 
 
 
106 aa  110  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  52.53 
 
 
110 aa  109  1e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  43.69 
 
 
107 aa  109  1e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  52.53 
 
 
110 aa  109  1e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  49.49 
 
 
112 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  47.57 
 
 
106 aa  107  4e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.93751e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  47.47 
 
 
107 aa  107  8e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  53.12 
 
 
110 aa  106  9e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  51.49 
 
 
106 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  49.49 
 
 
107 aa  105  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  45.63 
 
 
106 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  49.49 
 
 
110 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  52.04 
 
 
109 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  49.49 
 
 
109 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  50.51 
 
 
110 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  51.04 
 
 
110 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  47.96 
 
 
109 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  47.96 
 
 
109 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  47.96 
 
 
109 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  48.45 
 
 
108 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  45.45 
 
 
106 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  45.36 
 
 
110 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  47.47 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  47.47 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  46.94 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  47.47 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  47.47 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  52.04 
 
 
109 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  47.47 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  46.46 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  46.46 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  44.44 
 
 
106 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  51.85 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  46.46 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  46.46 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  46.46 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  46.46 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  46.46 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  46.46 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  45.45 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  46.24 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.62977e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  51.35 
 
 
106 aa  90.5  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
272 aa  81.3  4e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  41.77 
 
 
100 aa  80.9  5e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  43.04 
 
 
158 aa  80.9  6e-15  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  38.32 
 
 
130 aa  79.7  1e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 
656 aa  79.7  1e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 
130 aa  76.6  9e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  44.09 
 
 
254 aa  74.3  6e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 
263 aa  72.8  2e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  39.56 
 
 
108 aa  72  3e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  43.84 
 
 
245 aa  70.5  8e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
144 aa  68.2  4e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
282 aa  67.4  6e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40 
 
 
277 aa  67  8e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.11 
 
 
123 aa  66.6  1e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
145 aa  66.6  1e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  34.29 
 
 
141 aa  66.6  1e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 
144 aa  66.6  1e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  40 
 
 
260 aa  65.9  2e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  5.62605e-07 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.73 
 
 
189 aa  65.5  2e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  40 
 
 
260 aa  65.9  2e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  33.68 
 
 
106 aa  65.1  3e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  37.5 
 
 
229 aa  65.1  3e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 
124 aa  64.7  4e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 
216 aa  64.7  4e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  40.51 
 
 
141 aa  64.7  4e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
144 aa  64.7  4e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  37.33 
 
 
261 aa  63.9  6e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  36.96 
 
 
102 aa  63.9  7e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 
124 aa  63.9  7e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 
144 aa  63.9  8e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  31.76 
 
 
280 aa  63.5  9e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.00812e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 
133 aa  63.5  1e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  35.14 
 
 
107 aa  63.2  1e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.8 
 
 
138 aa  62.4  2e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  39.74 
 
 
284 aa  62.4  2e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 
144 aa  62  2e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
158 aa  62.4  2e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03873e-06 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  32.71 
 
 
144 aa  62  2e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
144 aa  62.4  2e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63421e-05 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 
102 aa  62  3e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>