More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2975 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  70.97 
 
 		 159 aa  188  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  68.85 
 
 		 135 aa  181  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  65.6 
 
 		 131 aa  173  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  62.9 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 136 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  58.65 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  57.97 
 
 		 138 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  65.25 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  59.4 
 
 		 135 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  64.96 
 
 		 131 aa  163  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 131 aa  163  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  63.79 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  65.25 
 
 		 137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  62.07 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  64.66 
 
 		 133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  62.07 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  63.79 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  61.98 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  59.68 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  61.21 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  60.33 
 
 		 134 aa  157  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  62.5 
 
 		 136 aa  157  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  59.68 
 
 		 138 aa  156  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  62.93 
 
 		 131 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  58.59 
 
 		 128 aa  155  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  59.13 
 
 		 133 aa  155  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  59.5 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  59.17 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  58.68 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  61.67 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  60.16 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 183 aa  154  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  58.97 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  58.26 
 
 		 133 aa  153  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 128 aa  153  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  57.03 
 
 		 128 aa  153  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  61.16 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  59.5 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  57.85 
 
 		 136 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  63.64 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  57.85 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  59.35 
 
 		 151 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  59.5 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  59.5 
 
 		 142 aa  151  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  57.02 
 
 		 137 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  59.68 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 133 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  56.91 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  58.62 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  60.16 
 
 		 132 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  60.18 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  61.95 
 
 		 139 aa  150  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 131 aa  150  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  59.38 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  57.5 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  55.56 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  55.47 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  58.77 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 		 167 aa  147  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  56.2 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  60.34 
 
 		 180 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  59.5 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  59.5 
 
 		 163 aa  146  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  59.48 
 
 		 180 aa  146  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  56.67 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  54.69 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  57.72 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  61.16 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  54.69 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  51.94 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  55.28 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  58.33 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  53.79 
 
 		 137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 		 137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  51.94 
 
 		 137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  60.18 
 
 		 134 aa  143  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 		 143 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  54.47 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  56.67 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  59.48 
 
 		 142 aa  141  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  55.56 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  50.37 
 
 		 154 aa  141  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  60.34 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>