More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1689 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  100 
 
 		 104 aa  213  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  47.12 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  50.54 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  47.12 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  47.12 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  46.15 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  46.15 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  46.15 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0451  30S ribosomal protein S6  46.15 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000202528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  43.56 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  48.39 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  46.24 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  41.94 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  37.96 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 134 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  40.91 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  44.57 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  36.54 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  36.54 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  43.01 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  43.01 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1337  30S ribosomal protein S6  45.16 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.021992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1032  30S ribosomal protein S6  45.16 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3435  30S ribosomal protein S6  39.09 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  41.11 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3592  30S ribosomal protein S6  39.09 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  38.18 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  38.18 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  45.56 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  36.11 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  44.68 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  39.58 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  38.18 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  38.18 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  38.18 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  38.18 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  38.18 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 134 aa  76.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3419  ribosomal protein S6  40.62 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797124  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  38.95 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  39.22 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  38.04 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  38.78 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  34.91 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  37.27 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  37.27 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0657  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  39.39 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  34.55 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>