258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1226 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  283  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  52.05 
 
 
149 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  48.61 
 
 
147 aa  147  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  45.52 
 
 
147 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  44.44 
 
 
147 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  44.44 
 
 
147 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  44.44 
 
 
147 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  44.44 
 
 
147 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  41.38 
 
 
151 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  49.32 
 
 
148 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  45.83 
 
 
147 aa  140  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  44.83 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  46.21 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  43.75 
 
 
147 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  47.92 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  49.31 
 
 
149 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  46.67 
 
 
150 aa  136  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  44.44 
 
 
147 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  47.59 
 
 
148 aa  133  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  42.36 
 
 
147 aa  133  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  45.14 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  42.76 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  47.59 
 
 
146 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  44.3 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  44.3 
 
 
149 aa  130  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  47.55 
 
 
145 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  43.62 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  43.97 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  48.28 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  44.44 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  44.14 
 
 
147 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  43.97 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  40.69 
 
 
147 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  47.59 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  41.55 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  42.07 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  124  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  124  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  43.84 
 
 
147 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  46.1 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  42.96 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  39.6 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  47.59 
 
 
148 aa  124  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  43.15 
 
 
147 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  39.19 
 
 
152 aa  124  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  46.98 
 
 
152 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  46.31 
 
 
152 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  46.31 
 
 
152 aa  121  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  44.37 
 
 
148 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  43.45 
 
 
147 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  43.57 
 
 
147 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  43.57 
 
 
147 aa  121  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  43.57 
 
 
147 aa  121  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1347  GatB/YqeY  44.14 
 
 
147 aa  120  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  43.57 
 
 
147 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  43.57 
 
 
147 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  43.57 
 
 
147 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2988  GatB/Yqey domain-containing protein  45.14 
 
 
147 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000480626  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3085  GatB/Yqey domain-containing protein  45.14 
 
 
147 aa  120  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000446062  hitchhiker  0.00030049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  40.82 
 
 
151 aa  120  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  42.76 
 
 
147 aa  120  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  42.07 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  44.97 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  42.86 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2906  GatB/Yqey domain-containing protein  44.44 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160635  normal  0.0394682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  39.6 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  40 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  43.57 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  42.07 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  42.25 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  40.85 
 
 
148 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  40.69 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  44.68 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  35.21 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  37.41 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0328  GatB/Yqey domain-containing protein  42.96 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000906873  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  41.38 
 
 
148 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  37.41 
 
 
149 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  41.38 
 
 
148 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  41.1 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  40.28 
 
 
148 aa  114  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  43.06 
 
 
149 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  42.86 
 
 
148 aa  114  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  40.97 
 
 
149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  37.24 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  37.24 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  37.93 
 
 
149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  40.97 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  40.94 
 
 
167 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  39.31 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  37.24 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_002936  DET0349  GatB/YqeY domain-containing protein  41.55 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000526076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  40 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  36.11 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  43.17 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  37.93 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  42.96 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_289  GatB domain containing protein  41.55 
 
 
149 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000397667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>