More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1195 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 417 aa  848    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  62.2 
 
 		 423 aa  542  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  61.34 
 
 		 426 aa  521  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 421 aa  519  1e-146  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  58.85 
 
 		 424 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 420 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 424 aa  507  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  57.18 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 427 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  56.46 
 
 		 422 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  55.98 
 
 		 424 aa  484  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 424 aa  481  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 424 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 424 aa  481  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 424 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 421 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 423 aa  481  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 424 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 422 aa  481  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 424 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 423 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 424 aa  480  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 424 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  54.31 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  55.34 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  55.58 
 
 		 432 aa  476  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 433 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  56.46 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 430 aa  471  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 423 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 427 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 422 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 423 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 428 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 427 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 427 aa  464  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  54.8 
 
 		 430 aa  463  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 430 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>