290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0147 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
101 aa  204  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.91893e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  49.49 
 
 
103 aa  101  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 
95 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  47.31 
 
 
91 aa  82  3e-15  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 
109 aa  80.1  1e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.69115e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  41.18 
 
 
109 aa  78.6  3e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  39.8 
 
 
106 aa  77.8  5e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  40.66 
 
 
103 aa  77.8  5e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  42.67 
 
 
107 aa  77.4  7e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  41.94 
 
 
116 aa  77  8e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  42.35 
 
 
106 aa  76.3  1e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  44.87 
 
 
92 aa  76.6  1e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  40.74 
 
 
106 aa  76.3  1e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  34.91 
 
 
168 aa  76.6  1e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  42.5 
 
 
113 aa  76.3  1e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  44.87 
 
 
92 aa  75.9  2e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.32016e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  46.75 
 
 
92 aa  75.5  2e-13  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  3.96106e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 
108 aa  75.1  3e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 
90 aa  74.7  4e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1576  preprotein translocase subunit YajC  39.53 
 
 
88 aa  74.7  4e-13  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 
93 aa  74.3  5e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  32.77 
 
 
133 aa  74.3  5e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 
92 aa  74.3  5e-13  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 
111 aa  73.9  7e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  39.33 
 
 
143 aa  73.6  8e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.2041e-07  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 
111 aa  73.2  1e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  37.25 
 
 
118 aa  73.6  1e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 
106 aa  73.6  1e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  38.75 
 
 
105 aa  73.6  1e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 
137 aa  73.2  1e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  35.37 
 
 
93 aa  73.2  1e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  40.23 
 
 
143 aa  72.8  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  35.87 
 
 
94 aa  72.8  2e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  32.98 
 
 
96 aa  72  2e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  37.25 
 
 
133 aa  72  2e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
144 aa  72  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
110 aa  72  3e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36.67 
 
 
123 aa  72  3e-12  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
115 aa  71.2  4e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 
115 aa  71.6  4e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
115 aa  71.2  4e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  35.56 
 
 
120 aa  70.9  6e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 
114 aa  70.5  7e-12  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 
125 aa  70.5  7e-12  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  35.56 
 
 
109 aa  70.5  7e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  33.02 
 
 
118 aa  70.5  9e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  38.16 
 
 
114 aa  69.7  1e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  40.28 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
91 aa  69.7  1e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.07658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  30.34 
 
 
116 aa  69.7  1e-11  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3621  preprotein translocase, YajC subunit  37.04 
 
 
118 aa  70.1  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52664e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  41.43 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  40.28 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  32.18 
 
 
90 aa  69.7  1e-11  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  30.34 
 
 
116 aa  69.3  2e-11  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  38.37 
 
 
108 aa  69.3  2e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.08918e-08  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  34.44 
 
 
109 aa  69.3  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  30.93 
 
 
126 aa  68.9  2e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
117 aa  68.6  3e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  43.48 
 
 
146 aa  68.6  3e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  38.16 
 
 
93 aa  68.6  3e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  36.84 
 
 
146 aa  68.2  4e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
121 aa  68.2  4e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  33.72 
 
 
133 aa  68.2  4e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 
91 aa  67.8  5e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  41.38 
 
 
118 aa  67.8  5e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  33.71 
 
 
104 aa  67.8  5e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 
111 aa  67.8  5e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 
111 aa  67.8  5e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 
112 aa  67.8  5e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  2.20066e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  43.28 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
113 aa  67.4  6e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  43.94 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  43.94 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  43.94 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  43.94 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  39.08 
 
 
117 aa  67.4  6e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  43.94 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  1.05955e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  44.62 
 
 
110 aa  67.8  6e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  43.94 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  43.94 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  44.62 
 
 
110 aa  67.8  6e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  37.78 
 
 
119 aa  67.4  6e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  43.94 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  44.62 
 
 
110 aa  67.8  6e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  44.62 
 
 
110 aa  67.8  6e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  44.62 
 
 
110 aa  67.8  6e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
110 aa  67.4  7e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
113 aa  67  8e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  38.16 
 
 
120 aa  67  8e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  37.36 
 
 
154 aa  67  8e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1348  preprotein translocase, YajC subunit  34 
 
 
123 aa  67  8e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  36.73 
 
 
112 aa  67  9e-11  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  38.03 
 
 
123 aa  67  9e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  42.25 
 
 
111 aa  67  9e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 
110 aa  66.2  1e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  37.8 
 
 
110 aa  66.2  1e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  35.53 
 
 
109 aa  66.6  1e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
113 aa  66.6  1e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1049  preprotein translocase subunit YajC  39.02 
 
 
91 aa  66.6  1e-10  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>