More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1709 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.82 
 
 		 473 aa  782    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 		 470 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  69.1 
 
 		 464 aa  646    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 470 aa  948    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12050  ATP synthase, F1 beta subunit  66.81 
 
 		 479 aa  635    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.26 
 
 		 468 aa  800    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  70.17 
 
 		 465 aa  655    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.16 
 
 		 468 aa  722    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.66 
 
 		 469 aa  793    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.66 
 
 		 469 aa  793    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.26 
 
 		 468 aa  800    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.66 
 
 		 469 aa  793    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.7 
 
 		 476 aa  659    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 		 472 aa  653    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  93.83 
 
 		 470 aa  900    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.31 
 
 		 503 aa  645    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 468 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 468 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.82 
 
 		 473 aa  780    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.81 
 
 		 470 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.48 
 
 		 470 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.66 
 
 		 469 aa  793    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.81 
 
 		 462 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 		 465 aa  639    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 		 470 aa  646    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 		 481 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.75 
 
 		 475 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  93.83 
 
 		 470 aa  900    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.68 
 
 		 475 aa  708    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 		 471 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  74.09 
 
 		 467 aa  693    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.62 
 
 		 468 aa  798    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 		 465 aa  654    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 		 465 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 		 470 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.44 
 
 		 493 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.26 
 
 		 464 aa  788    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.52 
 
 		 470 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.28 
 
 		 469 aa  731    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.49 
 
 		 504 aa  695    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.56 
 
 		 480 aa  697    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.45 
 
 		 466 aa  717    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.99 
 
 		 468 aa  744    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.83 
 
 		 468 aa  799    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.66 
 
 		 469 aa  793    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.09 
 
 		 465 aa  653    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 		 471 aa  641    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 471 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  66.6 
 
 		 487 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  83.3 
 
 		 469 aa  800    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.39 
 
 		 467 aa  632  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.39 
 
 		 467 aa  631  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 472 aa  628  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  67.53 
 
 		 470 aa  629  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4136  ATP synthase F1, beta subunit  66.95 
 
 		 478 aa  628  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 513 aa  627  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  67.03 
 
 		 468 aa  630  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.32 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.1 
 
 		 470 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3630  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.11 
 
 		 486 aa  625  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.0018377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  65.81 
 
 		 485 aa  624  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 484 aa  627  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.25 
 
 		 481 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.43 
 
 		 476 aa  625  1e-178  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11337  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.74 
 
 		 486 aa  626  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3876  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 		 509 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.12 
 
 		 474 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 472 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  65.45 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 		 509 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0581627  decreased coverage  0.00495302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3862  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 		 517 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00275996  normal  0.016479 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.3 
 
 		 473 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4012  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.89 
 
 		 485 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.44 
 
 		 462 aa  621  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 		 464 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  65.77 
 
 		 501 aa  622  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  68.4 
 
 		 503 aa  622  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  65.95 
 
 		 493 aa  622  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4328  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.1 
 
 		 475 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0241966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3916  ATP synthase F1, beta subunit  65.3 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.876404  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.87 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.75 
 
 		 475 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1921  ATP synthase F1, beta subunit  67.32 
 
 		 482 aa  618  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0256265  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.7 
 
 		 475 aa  620  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.75 
 
 		 475 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  68.69 
 
 		 493 aa  618  1e-176  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.16 
 
 		 513 aa  618  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  66.31 
 
 		 472 aa  618  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.52 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.59 
 
 		 484 aa  618  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3346  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.17 
 
 		 467 aa  614  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185597  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.44 
 
 		 484 aa  616  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.47 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.89 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03113  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.5 
 
 		 468 aa  615  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.38 
 
 		 486 aa  614  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.24 
 
 		 465 aa  616  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.16 
 
 		 463 aa  616  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 462 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 462 aa  614  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>