140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2078 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  100 
 
 
320 aa  640  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  64.78 
 
 
584 aa  417  1e-115  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  43.24 
 
 
341 aa  245  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  42.61 
 
 
322 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  43.85 
 
 
319 aa  236  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  40.21 
 
 
329 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  39.2 
 
 
325 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  39.51 
 
 
337 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  37.06 
 
 
329 aa  221  1e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  37.26 
 
 
331 aa  215  7e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  34.97 
 
 
343 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  35.78 
 
 
338 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  42.55 
 
 
270 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  38.85 
 
 
333 aa  206  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  35.95 
 
 
321 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  40.71 
 
 
334 aa  202  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  35.67 
 
 
347 aa  201  1e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  38.3 
 
 
322 aa  201  1e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  40.42 
 
 
336 aa  197  2e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.51 
 
 
323 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  37.81 
 
 
323 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  36.4 
 
 
325 aa  196  4e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  33.02 
 
 
341 aa  196  5e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  35.07 
 
 
323 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  35.14 
 
 
322 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  39.58 
 
 
335 aa  195  8e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  34.92 
 
 
323 aa  195  8e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  36.19 
 
 
323 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  36.21 
 
 
329 aa  195  9e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  34.06 
 
 
337 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.19 
 
 
323 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.19 
 
 
323 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.19 
 
 
323 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  37.32 
 
 
326 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.19 
 
 
323 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  33.02 
 
 
341 aa  195  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  37.32 
 
 
326 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  35.37 
 
 
334 aa  194  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  36.18 
 
 
321 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  36.04 
 
 
325 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  40.5 
 
 
359 aa  193  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  38.35 
 
 
321 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  36.04 
 
 
344 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  38.35 
 
 
321 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  38.35 
 
 
321 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.19 
 
 
323 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  38.35 
 
 
321 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  34.28 
 
 
324 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.87 
 
 
323 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  34.05 
 
 
317 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  37.63 
 
 
321 aa  189  6e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.41 
 
 
321 aa  189  6e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  36.24 
 
 
328 aa  189  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  36.27 
 
 
329 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  35.34 
 
 
322 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  33.22 
 
 
324 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  32.75 
 
 
317 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  35.31 
 
 
323 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  31.99 
 
 
317 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  35.34 
 
 
322 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  32.75 
 
 
317 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  33.69 
 
 
321 aa  184  1e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  32.92 
 
 
324 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  33.57 
 
 
316 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  38.11 
 
 
320 aa  180  3e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  34.27 
 
 
330 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  32.62 
 
 
331 aa  174  2e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.26 
 
 
327 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  34.42 
 
 
320 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  30.64 
 
 
327 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  34.95 
 
 
332 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  33.56 
 
 
332 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  34.64 
 
 
298 aa  166  5e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  33.57 
 
 
319 aa  165  1e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  32.21 
 
 
349 aa  163  4e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  31.85 
 
 
349 aa  163  4e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  35.62 
 
 
322 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  31.32 
 
 
313 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  30.21 
 
 
328 aa  152  6e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  29.39 
 
 
340 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  28.3 
 
 
370 aa  149  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  33.03 
 
 
329 aa  147  2e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.52 
 
 
352 aa  128  1e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  27.85 
 
 
331 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  29.55 
 
 
355 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  26.88 
 
 
640 aa  120  4e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.3 
 
 
344 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  25.49 
 
 
344 aa  117  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  29.43 
 
 
322 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  27.27 
 
 
329 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  25.47 
 
 
326 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  25.09 
 
 
354 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  27.36 
 
 
344 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  24.57 
 
 
365 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  25.79 
 
 
384 aa  92.4  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  25 
 
 
315 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  23.28 
 
 
324 aa  89.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  25 
 
 
328 aa  89  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  22.38 
 
 
324 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  24.38 
 
 
334 aa  84.3  2e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>