More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2982 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 608 aa  1209    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 444 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 611 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 619 aa  212  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 571 aa  212  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 604 aa  210  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 594 aa  210  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 590 aa  210  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 607 aa  210  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  29.74 
 
 		 613 aa  209  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 591 aa  208  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 612 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 600 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 571 aa  206  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 597 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  26.85 
 
 		 613 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  26.85 
 
 		 613 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  26.85 
 
 		 613 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  26.85 
 
 		 613 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  26.85 
 
 		 613 aa  204  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  26.85 
 
 		 613 aa  203  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  26.69 
 
 		 613 aa  203  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  29.74 
 
 		 613 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 609 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 608 aa  200  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 591 aa  199  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 584 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 597 aa  198  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 584 aa  197  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  31.69 
 
 		 581 aa  196  9e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  32.19 
 
 		 591 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  31.04 
 
 		 591 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  31.04 
 
 		 591 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  31.16 
 
 		 591 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 591 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  30.93 
 
 		 591 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 418 aa  192  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  27.86 
 
 		 591 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 621 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  31.28 
 
 		 599 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  27.86 
 
 		 591 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  27.69 
 
 		 591 aa  191  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 633 aa  191  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 589 aa  190  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  30.93 
 
 		 591 aa  190  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 593 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  32.74 
 
 		 537 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 453 aa  188  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 489 aa  186  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 581 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 589 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 581 aa  185  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 608 aa  183  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  26.87 
 
 		 608 aa  183  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 585 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  23.97 
 
 		 610 aa  181  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 585 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  31.19 
 
 		 584 aa  180  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  27.82 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  28.54 
 
 		 571 aa  178  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 599 aa  177  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  28.79 
 
 		 587 aa  177  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 456 aa  176  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  28.66 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  27.24 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  28.66 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 592 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 585 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  27.24 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  27.24 
 
 		 587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  28.51 
 
 		 587 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 566 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 754 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  30.1 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  27.8 
 
 		 571 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3738  histidine kinase  27.96 
 
 		 601 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018214  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 446 aa  174  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  28.51 
 
 		 587 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 590 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 597 aa  173  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 596 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  28.01 
 
 		 598 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 899 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13951  two-component sensor histidine kinase  28.27 
 
 		 686 aa  170  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0290244  normal  0.899353 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 608 aa  170  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  30.26 
 
 		 689 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 689 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 460 aa  167  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1659  histidine kinase  27.59 
 
 		 594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350157  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 608 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0379  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 574 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>