155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1987 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 71 aa  139  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.25 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.03 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.81 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  37.88 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.9 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  35.48 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1796  twin-arginine translocation protein TatB  41.07 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00434606  normal  0.066575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  37.29 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  40.68 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.29 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  37.25 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.54 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.46 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  33.78 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  39.22 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  41.67 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.11 
 
 		 234 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  38.18 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 165 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  37.25 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  38.46 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  36.62 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.09 
 
 		 214 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  36.21 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  38.18 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  36.21 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  42.55 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  37.93 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  36.92 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.21 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.36 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.17 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  37.25 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  37.93 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  37.93 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.92 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  39.22 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  37.5 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  40 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  37.25 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  38.46 
 
 		 231 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  37.25 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  37.25 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  37.25 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  36.21 
 
 		 162 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  36.36 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  40.38 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  39.22 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  40.43 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  35.71 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  37.93 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  34.48 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  36 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  37.93 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  35.29 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  42.55 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  37.31 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  37.31 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  34.48 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  35.71 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  34.48 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  40.43 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  33.33 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  36.21 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  37.88 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  30.77 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  33.33 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.71 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>