83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1139 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  85.68 
 
 
390 aa  636  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  770  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  85.93 
 
 
390 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  64.56 
 
 
399 aa  465  1e-130  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  42.55 
 
 
386 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  42.48 
 
 
386 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  42.54 
 
 
389 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  42.55 
 
 
386 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  42.69 
 
 
398 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  42.69 
 
 
398 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  41.03 
 
 
384 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  42.49 
 
 
400 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  43.4 
 
 
378 aa  255  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  35.44 
 
 
382 aa  252  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  44.19 
 
 
402 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  40.69 
 
 
386 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  41.8 
 
 
385 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  41.44 
 
 
379 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  41.64 
 
 
385 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  44.9 
 
 
386 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3140  hypothetical protein  39.21 
 
 
387 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  40.16 
 
 
380 aa  246  7e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  39.89 
 
 
384 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  39.89 
 
 
392 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  39.89 
 
 
392 aa  245  1e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  39.89 
 
 
392 aa  245  1e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  39.89 
 
 
392 aa  245  1e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  39.89 
 
 
392 aa  245  1e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2663  hypothetical protein  39.73 
 
 
387 aa  244  1e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  39.89 
 
 
384 aa  244  1e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2171  hypothetical protein  39.45 
 
 
387 aa  244  2e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  42.17 
 
 
389 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  34.89 
 
 
382 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3320  hypothetical protein  38.74 
 
 
387 aa  234  1e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  35.91 
 
 
374 aa  232  7e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  38.6 
 
 
393 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  39.18 
 
 
378 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38990  hypothetical protein  39.73 
 
 
387 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.880326  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  40.12 
 
 
387 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  33.43 
 
 
381 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  32.78 
 
 
382 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  37.57 
 
 
385 aa  226  5e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  35.33 
 
 
383 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  32.06 
 
 
447 aa  139  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  27.25 
 
 
460 aa  135  1e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  31.36 
 
 
368 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  26.79 
 
 
464 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  28.46 
 
 
371 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0982  domain of unknown function DUF1745  27.18 
 
 
666 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.505903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.1 
 
 
675 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.59 
 
 
669 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 
1186 aa  86.7  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5004  chemotaxis sensory transducer  27.14 
 
 
672 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.71371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1866  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.16 
 
 
650 aa  85.9  1e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  26.27 
 
 
387 aa  80.5  4e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  27.42 
 
 
408 aa  80.9  4e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2083  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 
647 aa  80.5  5e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0223967  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  23.14 
 
 
512 aa  75.1  2e-12  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  25.21 
 
 
417 aa  61.6  2e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  28.48 
 
 
401 aa  56.2  9e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  25.63 
 
 
379 aa  55.8  1e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  24.25 
 
 
376 aa  55.5  2e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  8.47515e-09 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  23.28 
 
 
381 aa  55.5  2e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  27.27 
 
 
365 aa  55.5  2e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  26.6 
 
 
395 aa  55.5  2e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  23.94 
 
 
373 aa  54.3  4e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  24.2 
 
 
383 aa  53.9  5e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  24.32 
 
 
416 aa  52.8  1e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  26.01 
 
 
396 aa  52  2e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33222e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25.44 
 
 
396 aa  52.4  2e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  26.42 
 
 
427 aa  51.2  3e-05  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  24.32 
 
 
400 aa  50.4  6e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  34.04 
 
 
387 aa  49.7  8e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  24.58 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  25.1 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  24.8 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  24.45 
 
 
379 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  23.51 
 
 
629 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  24.93 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 
396 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  24.32 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  21.86 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  20.92 
 
 
932 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>