34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3301 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  866    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  62.2 
 
 		 420 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  58.75 
 
 		 432 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  54.81 
 
 		 457 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  55.34 
 
 		 459 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  54.19 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  54.79 
 
 		 555 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  50.95 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  50 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  46.86 
 
 		 457 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  51.72 
 
 		 429 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  42.07 
 
 		 733 aa  347  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  32.22 
 
 		 929 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  30.52 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  30.11 
 
 		 525 aa  199  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  29.22 
 
 		 534 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  31.28 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  33.19 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  28.51 
 
 		 561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  31.17 
 
 		 503 aa  189  9e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  28.29 
 
 		 560 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  31.46 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  30.66 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  31.41 
 
 		 466 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  30.09 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  28.13 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  31.74 
 
 		 437 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  29.91 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  29.98 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  29.18 
 
 		 439 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  27.98 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.65 
 
 		 1967 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  28.07 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  39.13 
 
 		 536 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>