More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0058 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  100 
 
 		 333 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  59.09 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0022  hypothetical protein  58.84 
 
 		 336 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.45 
 
 		 335 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.02 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  59.45 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.45 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  59.45 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2241  dihydroflavonol-4-reductase family protein  59.15 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.45 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.45 
 
 		 335 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  59.45 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  59.45 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.45 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  59.45 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.45 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  59.45 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  59.45 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.18 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.75 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4126  hopanoid-associated sugar epimerase  57.32 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  57.19 
 
 		 340 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1781  hopanoid-associated sugar epimerase  58.18 
 
 		 329 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.889296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2122  hypothetical protein  58.18 
 
 		 329 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.744824  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1958  dihydroflavonol-4-reductase family protein  59.76 
 
 		 335 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  55.93 
 
 		 328 aa  352  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3152  hopanoid-associated sugar epimerase  54.88 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.43 
 
 		 330 aa  348  8e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  56.71 
 
 		 345 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.4 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  54.71 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  54.57 
 
 		 341 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  54.88 
 
 		 347 aa  339  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  53.66 
 
 		 341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  53.5 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  53.35 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  55.05 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.21 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.85 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.63 
 
 		 328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  48.63 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  49.24 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  48.64 
 
 		 329 aa  309  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.55 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.85 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  47.56 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  44.38 
 
 		 329 aa  272  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  44.38 
 
 		 329 aa  271  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  45.92 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  46.97 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  45.35 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.85 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.733793  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.06 
 
 		 329 aa  198  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0300237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.04 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1458  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.33 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000901734  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.97 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000791042 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.2 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.2 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.98 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  35.52 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.78 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.05 
 
 		 347 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.47 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.384866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.68 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.3 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.3 
 
 		 346 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.12 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  33.43 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1550  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.61 
 
 		 357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.12 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.04 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10140  oxidoreductase  34.05 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.78 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  31.38 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 336 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 		 336 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  30.18 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6145  putative NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.56 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804381  normal  0.0679863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>