75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2801 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2801  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 		 181 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2394  protein of unknown function DUF1486  96.73 
 
 		 180 aa  284  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1261  protein of unknown function DUF1486  65.13 
 
 		 182 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00537261  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  57.23 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5397  hypothetical protein  57.23 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  0.733155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  59.62 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  53.11 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0474  hypothetical protein  53.61 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  58.94 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  59.33 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0455  hypothetical protein  51.81 
 
 		 212 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0987  hypothetical protein  59.33 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.983826  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1469  hypothetical protein  59.33 
 
 		 185 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  56.38 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  56.38 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  56.38 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4152  hypothetical protein  56.39 
 
 		 214 aa  163  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  55.7 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  55.7 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  55.7 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  55.7 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3693  hypothetical protein  56.39 
 
 		 214 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  35.88 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  35.88 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0930  putative lipoprotein  37.06 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0741  hypothetical protein  36.84 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  37.43 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0749  hypothetical protein  41.01 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4442  putative lipoprotein  36.47 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.987994  normal  0.460875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0892  putative lipoprotein  35.29 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0932  putative lipoprotein  34.07 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6654500000000002e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0746  hypothetical protein  41.04 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00470157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  85.1  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  36 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  29.13 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  29.17 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  32.77 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  32.81 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  34.88 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  30 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  29.63 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6186  protein of unknown function DUF1486  34.04 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3831  hypothetical protein  32.65 
 
 		 146 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  30.53 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  32.29 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  24.81 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  32.53 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  27.27 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  34.15 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3560  protein of unknown function DUF1486  29.17 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  26.4 
 
 		 137 aa  52  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  28.15 
 
 		 147 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  26.35 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  26.32 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  21.8 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  32.91 
 
 		 123 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 149 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  27.69 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  23.97 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  26.05 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  26.74 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  25.53 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  24.32 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  27.91 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  26.74 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  26.19 
 
 		 284 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  31.25 
 
 		 85 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2718  protein of unknown function DUF1486  29.79 
 
 		 119 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000849743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1691  protein of unknown function DUF1486  21.6 
 
 		 139 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  25.85 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  30.43 
 
 		 126 aa  41.2  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>