97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1321 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  91.34 
 
 		 231 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  76.27 
 
 		 242 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  66.38 
 
 		 245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  68.6 
 
 		 216 aa  298  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  56.61 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  58.08 
 
 		 222 aa  258  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  55.87 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  55.4 
 
 		 214 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  54.55 
 
 		 218 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  58.57 
 
 		 211 aa  241  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  58.57 
 
 		 211 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  58.57 
 
 		 211 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  55.36 
 
 		 233 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  53.59 
 
 		 218 aa  234  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  54.89 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  55.22 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  52.68 
 
 		 230 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  52.68 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  52.68 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  53.33 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  50 
 
 		 217 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  50.24 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  48.8 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  48.1 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  32.06 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  32.02 
 
 		 209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  31.1 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  30.05 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  38.62 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  34.85 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  32.61 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  34.15 
 
 		 259 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  33.85 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  34.83 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.11 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  31.9 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  29.79 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  29.79 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  29.79 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  29.79 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  29.79 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  29.79 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  29.79 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  27.39 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  30.41 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  30.41 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  30.35 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  33.01 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  30.77 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  30.32 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  26.88 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  26.94 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  28.43 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  30.82 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  28.93 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  28.93 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  27.23 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  26.13 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  29.1 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  31.43 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  28.06 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  34.76 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  21.84 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  27.36 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  26.84 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  24.46 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  29.36 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  25.41 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  23.5 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  27.27 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  23.2 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2764  hypothetical protein  23.74 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  24.34 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2060  hypothetical protein  23.77 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0138682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  21.81 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  24.35 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  25.49 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  22.8 
 
 		 300 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1922  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  24.39 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  23.56 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1375  DSBA oxidoreductase  20 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000103023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  25.2 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  22.48 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.75 
 
 		 336 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>