More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0524 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  93.24 
 
 		 222 aa  423  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.98 
 
 		 219 aa  330  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.52 
 
 		 219 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  67.32 
 
 		 213 aa  287  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  53.47 
 
 		 215 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  57.71 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  57.36 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  57.35 
 
 		 206 aa  241  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  53.17 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.97 
 
 		 213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.67 
 
 		 211 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.26 
 
 		 211 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.22 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.27 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  46.6 
 
 		 198 aa  158  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  43.98 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.52 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  43.01 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.39 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.87 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  39.11 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.76 
 
 		 211 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.16 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  37 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  40.1 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  41.06 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  38.69 
 
 		 208 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.82 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  38.69 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  39.46 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  35.86 
 
 		 207 aa  127  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00444  glutathione S-transferase  58.25 
 
 		 116 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0188129  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  36.82 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 		 204 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  36.92 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  37.44 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.67 
 
 		 203 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.38 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.64 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.44 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.02 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.78 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  35.5 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  35 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  37.82 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.31 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.98 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.76 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  35.23 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.81 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  35.86 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  35.35 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.81 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  34 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  35.35 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  34.98 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  35.05 
 
 		 186 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  32.38 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  35.05 
 
 		 186 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  30.88 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.42 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  34.18 
 
 		 183 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2823  glutathione S-transferase  33 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  33.67 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  35.84 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.12 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  36.06 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  33.67 
 
 		 184 aa  92.4  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2020  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.78 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2600  glutathione S-transferase  32.02 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.465574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  26.5 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.69 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.78 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  33.17 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  32.5 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  33.8 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  29.3 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  32.31 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  28 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>