More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2645 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  283  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  65.93 
 
 		 143 aa  186  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  55.08 
 
 		 265 aa  133  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 		 133 aa  129  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  55.36 
 
 		 263 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  54.62 
 
 		 176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  61.86 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 		 260 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  43.97 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  50.43 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  50.43 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  43.97 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  43.97 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  50.43 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  44.83 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 		 165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 		 136 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  41.74 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  48.72 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  43.36 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  40.87 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5863  thioesterase superfamily protein  45.16 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1351  LysR, substrate-binding  60.61 
 
 		 230 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  40.52 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1190  thioesterase superfamily protein  39.82 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  39.82 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.28 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  41.28 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  41.28 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.28 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.28 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.28 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.28 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 		 168 aa  84  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2078  thioesterase superfamily protein  49.12 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.571486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1636  thioesterase superfamily protein  49.12 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.196276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  39.45 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  40.37 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3521  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.761017  normal  0.0424383 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.45 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.45 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  42.86 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  30.83 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.79 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  38.79 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  38.79 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  38.79 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 171 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.79 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  38.79 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.79 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.79 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  38.79 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  38.4 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  39.45 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>