More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4605 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 318 aa  638    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  74.92 
 
 		 314 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  51.98 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  48.37 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  40.29 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  37.81 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  36.9 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 		 705 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  28.98 
 
 		 652 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  36.25 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 387 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.33 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  30.86 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.08 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 327 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  31.09 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.45 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  28.9 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  33.47 
 
 		 284 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 714 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 1267 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  24.67 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 1267 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  33.63 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.18 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  25.89 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 341 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  29.57 
 
 		 283 aa  99.8  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 342 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 327 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>