More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4233 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
405 aa  822    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  51.52 
 
 
408 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  43.11 
 
 
405 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  35.94 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
432 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  32.62 
 
 
413 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
421 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
402 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
403 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 
274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
409 aa  153  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
404 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
418 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  30.24 
 
 
442 aa  149  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
411 aa  147  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  25.72 
 
 
414 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
406 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
415 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
399 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
399 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
415 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  28.54 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  39.7 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  25.74 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  29.18 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  28.64 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
389 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.28 
 
 
413 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  39.77 
 
 
388 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  28.65 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 
436 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
414 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  26.24 
 
 
405 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
405 aa  114  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
376 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
396 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
1340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
456 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
399 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
405 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.68 
 
 
429 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
407 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
360 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
499 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
406 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
397 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
416 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 
412 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  23.15 
 
 
402 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
422 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  34.65 
 
 
700 aa  99.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  21.36 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  37.28 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 
387 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
396 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  26.93 
 
 
394 aa  96.3  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  25.32 
 
 
1119 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
1156 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0314  hypothetical protein  29.04 
 
 
369 aa  92  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
535 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  27.12 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  26.87 
 
 
443 aa  90.5  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
443 aa  90.1  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  35.67 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
994 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
703 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  29.56 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  25.13 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.49 
 
 
860 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
956 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
414 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  25.22 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
902 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  34.53 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  28.96 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>