63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4120 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  88.77 
 
 
374 aa  695    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  766    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  44.53 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  44.62 
 
 
376 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.59 
 
 
455 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  46.6 
 
 
354 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  36.99 
 
 
653 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  45.21 
 
 
803 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  44.15 
 
 
801 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  42.45 
 
 
384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  44.86 
 
 
662 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  44.39 
 
 
375 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.94 
 
 
638 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  44.74 
 
 
492 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  44.04 
 
 
480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  43.65 
 
 
350 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  41.07 
 
 
654 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  36.84 
 
 
415 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.89 
 
 
722 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  34.92 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  41.26 
 
 
421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  41.26 
 
 
400 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  36.55 
 
 
635 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  38.57 
 
 
642 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.39 
 
 
689 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.46 
 
 
688 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  36.45 
 
 
347 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  39.66 
 
 
656 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  37.87 
 
 
345 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  40 
 
 
340 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  39.11 
 
 
459 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  40.58 
 
 
338 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  35.1 
 
 
451 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.68 
 
 
597 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  37.39 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  38.82 
 
 
665 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  37.13 
 
 
596 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  35.74 
 
 
597 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  35.29 
 
 
235 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  35.92 
 
 
601 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.54 
 
 
398 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  36 
 
 
586 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  36.64 
 
 
600 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  39.66 
 
 
283 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.39 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.6 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  34.69 
 
 
601 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.5 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  36.96 
 
 
362 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.24 
 
 
397 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.52 
 
 
374 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  33.8 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  41.94 
 
 
281 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.65 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3503  hypothetical protein  43.53 
 
 
131 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  33.73 
 
 
804 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
618 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.65 
 
 
500 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.89 
 
 
453 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  31.76 
 
 
862 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1704  hypothetical protein  34.13 
 
 
886 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.298194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.37 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1411  hypothetical protein  32.28 
 
 
886 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>