More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3594 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
421 aa  835  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  73.71 
 
 
418 aa  612  1e-174  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  52.98 
 
 
402 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  45.37 
 
 
402 aa  349  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  36.95 
 
 
410 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
432 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  34.26 
 
 
413 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
411 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
403 aa  185  2e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
405 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
405 aa  175  1e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  35.43 
 
 
402 aa  172  8e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  35.05 
 
 
402 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  5.3006e-10 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
405 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  30.97 
 
 
405 aa  167  3e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  40.41 
 
 
274 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
417 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
404 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
409 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
406 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.98 
 
 
413 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  27.61 
 
 
399 aa  156  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
414 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
434 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
389 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
406 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  27.44 
 
 
414 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
405 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
436 aa  149  1e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
402 aa  148  1e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
429 aa  146  7e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
401 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.22 
 
 
429 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  33.59 
 
 
399 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
408 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
410 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
407 aa  142  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
417 aa  141  2e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
417 aa  141  2e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
417 aa  141  2e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
415 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
396 aa  136  7e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
399 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
399 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
409 aa  132  8e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
415 aa  132  1e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  27.97 
 
 
415 aa  131  2e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
399 aa  132  2e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
415 aa  132  2e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
400 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  24.3 
 
 
394 aa  130  6e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
404 aa  129  8e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  25.58 
 
 
397 aa  129  1e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 
360 aa  129  1e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
416 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  21.93 
 
 
396 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
1340 aa  122  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
387 aa  122  1e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  43.21 
 
 
388 aa  122  1e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
392 aa  119  1e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
396 aa  117  4e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  33.99 
 
 
394 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  26.56 
 
 
402 aa  116  7e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
703 aa  115  1e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  42.6 
 
 
408 aa  115  1e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
376 aa  114  4e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
422 aa  110  4e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
413 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
456 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
435 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  28.19 
 
 
442 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  37.12 
 
 
401 aa  107  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 
392 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
1156 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  37.71 
 
 
371 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  22.33 
 
 
1119 aa  100  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
956 aa  97.1  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
410 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  28.24 
 
 
860 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
902 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
994 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
412 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
499 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  39.49 
 
 
700 aa  89.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
1106 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  26.14 
 
 
443 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
691 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
443 aa  86.7  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  40.44 
 
 
435 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
691 aa  85.9  1e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  36.61 
 
 
422 aa  86.3  1e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
535 aa  86.3  1e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  25.85 
 
 
402 aa  85.9  1e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  38.31 
 
 
433 aa  85.5  2e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
691 aa  84.3  4e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  38.57 
 
 
414 aa  84  5e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  4.69398e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
391 aa  81.6  2e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>