More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3400 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  90 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  65.52 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  55.17 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  59.74 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  62.34 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  64.18 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  51.19 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  54.76 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  54.88 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  59.21 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  59.21 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  68.85 
 
 		 75 aa  94.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  61.04 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  71.43 
 
 		 76 aa  94  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  54.65 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  54.12 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 76 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  69.35 
 
 		 74 aa  92  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  68.18 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  67.74 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  53.09 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  51.16 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  65.62 
 
 		 80 aa  90.5  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  53.09 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  69.84 
 
 		 75 aa  90.1  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  64.06 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  65.08 
 
 		 76 aa  89.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1459  30S ribosomal protein S18  62.2 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  50.56 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  58.73 
 
 		 76 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  50.56 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  57.35 
 
 		 74 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  51.19 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  58.02 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  53.52 
 
 		 112 aa  87.4  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  54.79 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  57.97 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0850  SSU ribosomal protein S18P  53.09 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  65.62 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  63.08 
 
 		 89 aa  84.3  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  60 
 
 		 70 aa  84  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  55 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  48.65 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  50 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  59.02 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  53.75 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  54.43 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0140  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1351  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0404596  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  57.58 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  51.19 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1773  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1211  SSU ribosomal protein S18P  55.26 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114712  normal  0.854081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  50 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3119  30S ribosomal protein S18  56.34 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.258718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2511  30S ribosomal protein S18  60.29 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.460729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0673  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00258481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  48.57 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0890  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 		 75 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  47.95 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3903  30S ribosomal protein S18  65.08 
 
 		 88 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000287817  normal  0.152503 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>