More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1459 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1459  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 81 aa  161  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4964  30S ribosomal protein S18  68.12 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0600  30S ribosomal protein S18  70 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000175941  unclonable  0.00000679911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3903  30S ribosomal protein S18  70 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000287817  normal  0.152503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  63.77 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  65.15 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0113  30S ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  63.49 
 
 		 78 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  55.41 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0398  30S ribosomal protein S18  48.1 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  59.38 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3637  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0682  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0448  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435788 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3782  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  54.05 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00745  30S ribosomal protein S18  48.65 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4763  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  51.35 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0373  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4735  30S ribosomal protein S18  52.7 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260572  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 80 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  58.06 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  62.71 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0740  ribosomal protein S18  54.55 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0452122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1901  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.162774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  47.95 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 		 94 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2132  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6994  ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2051  30S ribosomal protein S18  47.3 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.255921  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  70.83 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2008  30S ribosomal protein S18  56.06 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.922346  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03777  30S ribosomal protein S18  60.38 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3745  30S ribosomal protein S18  58.62 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00458678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  50.68 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2779  30S ribosomal protein S18  64.15 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000612799  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0493  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  53.62 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0422  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000044811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  51.43 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>