More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2336 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  100 
 
 
280 aa  580  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  50 
 
 
261 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  47.13 
 
 
264 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  43.19 
 
 
264 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  28.74 
 
 
247 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  28.88 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
252 aa  89  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.27 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  26.61 
 
 
241 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
233 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
244 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  31.27 
 
 
241 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.96 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  26.84 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  34.31 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.5 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.09 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  24.89 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  32.86 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  27.1 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  28.64 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  27.52 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  28.04 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  28.63 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  27.31 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  27.31 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  27.31 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  27.31 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  27.31 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  27.31 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  27.04 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  37.2 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  26.25 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  25.65 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  26.25 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  24.78 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  25.23 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.23 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  25.23 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  25.23 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  25.23 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  25.23 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  21.37 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  24.57 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.28 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
1106 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  24.57 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  30.82 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.08 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  24.14 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  26.21 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.5 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.5 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  25.52 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  24.78 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  27 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.22 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  27.94 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  41.12 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  38.78 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  24.78 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.25 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.69 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  26.5 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.5 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  30.23 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.51 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.86 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.5 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4211  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4277  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
243 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.86 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4438  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
252 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>