More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2003 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  55.18 
 
 		 664 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2132  acetate/CoA ligase  52.23 
 
 		 661 aa  646    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000882017  normal  0.24992 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  51.36 
 
 		 666 aa  656    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  52.22 
 
 		 631 aa  642    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  53.92 
 
 		 667 aa  670    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  72.76 
 
 		 644 aa  975    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  52.46 
 
 		 646 aa  646    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  49.62 
 
 		 660 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  50.92 
 
 		 654 aa  638    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  50 
 
 		 652 aa  639    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  55.98 
 
 		 655 aa  737    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  53.57 
 
 		 654 aa  667    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  52.08 
 
 		 666 aa  683    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.55 
 
 		 656 aa  718    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  53.5 
 
 		 664 aa  719    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  94.46 
 
 		 650 aa  1280    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  55.78 
 
 		 649 aa  721    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.74 
 
 		 658 aa  686    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  56.13 
 
 		 648 aa  732    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  55.01 
 
 		 657 aa  720    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.58 
 
 		 658 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  55.28 
 
 		 657 aa  728    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  53.54 
 
 		 632 aa  661    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  54.13 
 
 		 657 aa  675    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  61.83 
 
 		 639 aa  824    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  51.58 
 
 		 632 aa  640    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  54.27 
 
 		 667 aa  703    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  52.08 
 
 		 673 aa  689    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.02 
 
 		 666 aa  709    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  53.47 
 
 		 657 aa  686    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2823  acetyl-coenzyme A synthetase  49.24 
 
 		 659 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  51.08 
 
 		 661 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  50.62 
 
 		 653 aa  652    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  55.35 
 
 		 655 aa  712    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  50 
 
 		 660 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.21 
 
 		 656 aa  739    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  53.47 
 
 		 649 aa  658    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  49.39 
 
 		 660 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  65.31 
 
 		 631 aa  884    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  52.45 
 
 		 629 aa  671    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0706  acetate/CoA ligase  49.23 
 
 		 663 aa  651    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  52.71 
 
 		 632 aa  660    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  53.01 
 
 		 629 aa  674    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  54.25 
 
 		 661 aa  664    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  52.77 
 
 		 629 aa  664    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  57.87 
 
 		 643 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  51.38 
 
 		 657 aa  682    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  55.02 
 
 		 664 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  52.88 
 
 		 657 aa  722    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  53.72 
 
 		 663 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  100 
 
 		 650 aa  1347    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  49.61 
 
 		 649 aa  656    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  50.56 
 
 		 629 aa  636    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  49.24 
 
 		 651 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  50.54 
 
 		 680 aa  644    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  49.92 
 
 		 660 aa  660    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  65.05 
 
 		 632 aa  886    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  55.02 
 
 		 649 aa  714    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  54.49 
 
 		 652 aa  719    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  54.18 
 
 		 655 aa  694    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  52.85 
 
 		 652 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  52.6 
 
 		 667 aa  704    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.25 
 
 		 644 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  50.78 
 
 		 650 aa  641    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1286  acetate/CoA ligase  50.62 
 
 		 658 aa  656    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00108265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.3 
 
 		 655 aa  730    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  51.42 
 
 		 666 aa  652    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  51.23 
 
 		 658 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  69.8 
 
 		 653 aa  964    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  54.79 
 
 		 638 aa  677    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  64.89 
 
 		 632 aa  885    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  54.97 
 
 		 661 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  53.71 
 
 		 670 aa  663    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  53.1 
 
 		 647 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  51.74 
 
 		 645 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  52.7 
 
 		 658 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  51.89 
 
 		 645 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  50.78 
 
 		 659 aa  663    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.86 
 
 		 670 aa  704    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  54.86 
 
 		 660 aa  721    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  50.93 
 
 		 656 aa  666    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  54.21 
 
 		 656 aa  714    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  53.38 
 
 		 656 aa  678    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  51.65 
 
 		 644 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  56.72 
 
 		 660 aa  725    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  50.85 
 
 		 657 aa  659    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.88 
 
 		 667 aa  718    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  55.43 
 
 		 638 aa  707    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  53.27 
 
 		 631 aa  651    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  53.39 
 
 		 667 aa  689    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  53.23 
 
 		 660 aa  701    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  59.91 
 
 		 639 aa  830    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  65.93 
 
 		 631 aa  890    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  55.35 
 
 		 655 aa  712    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.53 
 
 		 661 aa  679    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  50.49 
 
 		 652 aa  642    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  50.25 
 
 		 664 aa  645    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  52.61 
 
 		 649 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1140  acetate/CoA ligase  50.96 
 
 		 665 aa  639    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  53.66 
 
 		 635 aa  655    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>