57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5339 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5339  CsgG family protein  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00570  putative lipoprotein  82.55 
 
 		 228 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27192  normal  0.120076 
 
 
-
 
NC_003296  RS01776  lipoprotein  83.9 
 
 		 227 aa  362  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00673998  normal  0.858527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0048  putative lipoprotein  82.76 
 
 		 228 aa  358  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1250  CsgG family protein  78.54 
 
 		 227 aa  344  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1457  curli production assembly/transport component CsgG  76.7 
 
 		 225 aa  343  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1337  curli production assembly/transport component CsgG  70.4 
 
 		 223 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.919367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1449  curli production assembly/transport component CsgG  70.4 
 
 		 223 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2723  curli production assembly/transport component CsgG  70.09 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4012  Curli production assembly/transport component CsgG  74.29 
 
 		 223 aa  328  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4279  Curli production assembly/transport component CsgG  73.46 
 
 		 223 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4600  Curli production assembly/transport component CsgG  72.99 
 
 		 223 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1390  curli production assembly/transport component CsgG  74.63 
 
 		 223 aa  325  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4221  Curli production assembly/transport component CsgG  72.38 
 
 		 223 aa  320  8e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3562  curli production assembly/transport component CsgG  67.12 
 
 		 224 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2999  curli production assembly/transport component CsgG  71.5 
 
 		 225 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2914  curli production assembly/transport component CsgG  71.36 
 
 		 225 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3024  curli production assembly/transport component CsgG  70.39 
 
 		 225 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3005  curli production assembly/transport component CsgG  70.39 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2391  twin-arginine translocation pathway signal  70.39 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5407  curli production assembly/transport component CsgG  64.13 
 
 		 226 aa  299  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3467  putative curli production assembly/transport component CsgG  67.77 
 
 		 301 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1651  putative curli production assembly/transport component CsgG  67.77 
 
 		 301 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3889  csgG family protein  67.77 
 
 		 225 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.816763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3970  csgG family protein  67.77 
 
 		 225 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3082  putative curli production assembly/transport component CsgG  67.77 
 
 		 301 aa  298  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.601979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0109  CsgG family protein  67.3 
 
 		 225 aa  296  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3206  curli production assembly/transport component CsgG, putative  70.15 
 
 		 207 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2891  curli production assembly/transport component CsgG, putative  69.65 
 
 		 207 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2759  Curli production assembly/transport component CsgG  63.06 
 
 		 226 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0880  outer membrane lipoprotein  61.11 
 
 		 224 aa  275  6e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1493  outer membrane lipoprotein  61.09 
 
 		 219 aa  271  5.000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0503324  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1131  curli production assembly/transport component CsgG subfamily protein  59.53 
 
 		 222 aa  266  2e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00305065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4121  curli production assembly/transport component CsgG  35.75 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1763  putative curli production assembly/transport component CsgG  34.56 
 
 		 324 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  33.63 
 
 		 321 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0391  curli production assembly/transport component CsgG  37.08 
 
 		 320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  36.52 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4674  curli production assembly/transport component CsgG  32 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.501006  normal  0.0721593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05526  hypothetical protein  32.16 
 
 		 322 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3425  putative lipoprotein  55.17 
 
 		 100 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3786  hypothetical protein  30.18 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0180472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1286  Curli production assembly/transport component CsgG  27.72 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.47736  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1195  hypothetical protein  23.77 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00195714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  28.95 
 
 		 332 aa  52  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1457  CsgG family protein, putative  33.03 
 
 		 330 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  26.24 
 
 		 340 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1155  curli production assembly/transport subunit CsgG  25.21 
 
 		 277 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1416  curli production assembly/transport subunit CsgG  25.21 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0591449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4187  hypothetical protein  29.33 
 
 		 574 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2096  curli production assembly/transport subunit CsgG  25.21 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2562  curli production assembly/transport component CsgG  25.21 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.25398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1156  curli production assembly/transport subunit CsgG  25.21 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01041  hypothetical protein  25.21 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.756314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2608  Curli production assembly/transport component CsgG  25.21 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0251589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01034  outer membrane lipoprotein  25.21 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.743614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1553  curli production assembly/transport component CsgG  25.21 
 
 		 277 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.301914  normal  0.209181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>