More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2039 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  100 
 
 
350 aa  697  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  42.72 
 
 
337 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  40.12 
 
 
350 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  42.86 
 
 
347 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  41.67 
 
 
351 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  42.72 
 
 
333 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  41.23 
 
 
351 aa  253  4e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  41.82 
 
 
350 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  41.82 
 
 
350 aa  248  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  40.58 
 
 
350 aa  245  7e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  41.59 
 
 
350 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.96347e-06  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  39.75 
 
 
346 aa  239  7e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  39.01 
 
 
371 aa  239  7e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  37.08 
 
 
332 aa  234  2e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  38.82 
 
 
346 aa  234  2e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  36.17 
 
 
332 aa  233  4e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  37.54 
 
 
332 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  40 
 
 
331 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  35.47 
 
 
355 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3583e-11 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  36.34 
 
 
335 aa  216  6e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  33.33 
 
 
354 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 
330 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 
330 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  33.43 
 
 
334 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  33.43 
 
 
334 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.93674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.94 
 
 
330 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  33.33 
 
 
330 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  35.49 
 
 
338 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.59336e-12  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  33.33 
 
 
330 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  32.63 
 
 
337 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  33.87 
 
 
356 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  34.56 
 
 
362 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  33.87 
 
 
356 aa  198  1e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  36.22 
 
 
384 aa  197  2e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  34.88 
 
 
355 aa  197  2e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  36 
 
 
337 aa  197  2e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  29.66 
 
 
346 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 
335 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.39413e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  30.72 
 
 
336 aa  187  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  30.89 
 
 
339 aa  185  1e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  34.91 
 
 
345 aa  185  1e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  36.04 
 
 
341 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  28.61 
 
 
335 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 
335 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  33.64 
 
 
351 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  33.64 
 
 
351 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  33.02 
 
 
357 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  33.64 
 
 
351 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  31.45 
 
 
325 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  34.94 
 
 
352 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  34.65 
 
 
368 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.39 
 
 
335 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  35.74 
 
 
352 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  31.45 
 
 
352 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  33.02 
 
 
351 aa  174  2e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  28.83 
 
 
341 aa  173  3e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  36.08 
 
 
351 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  33.02 
 
 
359 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  31.53 
 
 
366 aa  162  8e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
324 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  32.64 
 
 
346 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  28.48 
 
 
509 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  32.3 
 
 
347 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  33.87 
 
 
341 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  30.28 
 
 
346 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  30.28 
 
 
346 aa  148  1e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  26.85 
 
 
376 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  28.1 
 
 
376 aa  133  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  27.66 
 
 
397 aa  133  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  7.21375e-05  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.49 
 
 
531 aa  130  5e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  24.52 
 
 
376 aa  115  9e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  32.74 
 
 
388 aa  114  2e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  32.65 
 
 
395 aa  114  2e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  29.81 
 
 
350 aa  115  2e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  36.31 
 
 
182 aa  113  4e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  30.5 
 
 
366 aa  112  1e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  25.46 
 
 
335 aa  111  2e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  27.95 
 
 
347 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  30.45 
 
 
393 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  24.91 
 
 
517 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  31.56 
 
 
668 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 
395 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  32.82 
 
 
544 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  31.75 
 
 
417 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  31.75 
 
 
417 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  31.75 
 
 
417 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.9785e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  31.75 
 
 
417 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  2.1243e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  31.46 
 
 
402 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  31.75 
 
 
417 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 
417 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  31.46 
 
 
402 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 
359 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  31.28 
 
 
417 aa  106  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  29.13 
 
 
356 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  33.01 
 
 
542 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  29.67 
 
 
366 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  27.36 
 
 
364 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 
256 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  31.1 
 
 
544 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.56 
 
 
671 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>