More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1355 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  53.95 
 
 
158 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  53.95 
 
 
152 aa  152  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  54 
 
 
154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  51.97 
 
 
158 aa  150  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
172 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  51.25 
 
 
164 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  52.63 
 
 
160 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  49.04 
 
 
158 aa  148  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  51.32 
 
 
163 aa  148  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  43.04 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  50.98 
 
 
166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  43.75 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  53.33 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  50.66 
 
 
160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  50.66 
 
 
160 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  50.66 
 
 
160 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  50.65 
 
 
160 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
161 aa  143  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  52.48 
 
 
150 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  50.66 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  48.12 
 
 
166 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  52.94 
 
 
155 aa  141  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  44.72 
 
 
171 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
157 aa  140  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.75 
 
 
164 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.75 
 
 
164 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.75 
 
 
164 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  44.94 
 
 
156 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.75 
 
 
164 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  45.1 
 
 
162 aa  138  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  48.75 
 
 
164 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  47.4 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.58 
 
 
157 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  42.58 
 
 
157 aa  137  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  48.37 
 
 
154 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 
162 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  43.42 
 
 
154 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0472  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.08 
 
 
154 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.08 
 
 
154 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0451  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.08 
 
 
154 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0393  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.08 
 
 
154 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0384  protein-tyrosine-phosphatase  44.08 
 
 
154 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0381  protein-tyrosine-phosphatase  44.08 
 
 
154 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0407  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.08 
 
 
154 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  50 
 
 
159 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  48 
 
 
162 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  52.55 
 
 
172 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  45.45 
 
 
157 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4852  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  44.08 
 
 
154 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  49.01 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2613  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  51.25 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  47.68 
 
 
159 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0163  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.03 
 
 
145 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147103  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  47.68 
 
 
159 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  49.35 
 
 
159 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  49.35 
 
 
159 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  44.67 
 
 
161 aa  134  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  46.98 
 
 
162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  49.34 
 
 
152 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  47.5 
 
 
162 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10570  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01880)  41.33 
 
 
252 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836007  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  41.94 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  48.67 
 
 
155 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.62 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0521  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  43.42 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  41.72 
 
 
155 aa  132  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  46.54 
 
 
165 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  47.68 
 
 
165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.38 
 
 
157 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  44.81 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  45.28 
 
 
165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  46.1 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
154 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.44 
 
 
154 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.95 
 
 
164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  41.51 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  45.96 
 
 
154 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  46.05 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  40.52 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  48.7 
 
 
159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  48 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 
154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  43.4 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.51 
 
 
453 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  44.1 
 
 
186 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  49.01 
 
 
165 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  45.4 
 
 
196 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.88 
 
 
157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.37 
 
 
160 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17121  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.44 
 
 
155 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.871196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  40.72 
 
 
162 aa  124  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  46.25 
 
 
159 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>