98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1211 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
187 aa  370  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1210  protein of unknown function DUF820  82.98 
 
 
189 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0763  hypothetical protein  50.83 
 
 
189 aa  185  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.105804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  49.72 
 
 
187 aa  174  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  46.51 
 
 
188 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1389  protein of unknown function DUF820  39.25 
 
 
186 aa  158  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  44.62 
 
 
186 aa  158  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1423  protein of unknown function DUF820  41.95 
 
 
186 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4530  hypothetical protein  45.06 
 
 
162 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  41.4 
 
 
186 aa  148  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0449  protein of unknown function DUF820  37.43 
 
 
189 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391731  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0222  protein of unknown function DUF820  43.53 
 
 
193 aa  132  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10891  normal  0.109063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  43.62 
 
 
186 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  38.29 
 
 
194 aa  131  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1849  hypothetical protein  43.26 
 
 
188 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  42.86 
 
 
189 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  36.48 
 
 
195 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  38.64 
 
 
202 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3149  hypothetical protein  37.5 
 
 
185 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00139677  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  38.78 
 
 
191 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  35 
 
 
200 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  35 
 
 
200 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0030  protein of unknown function DUF820  40.46 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  32.26 
 
 
186 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  39.57 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  31.18 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2203  protein of unknown function DUF820  39.87 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.1814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  34.29 
 
 
184 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3738  protein of unknown function DUF820  29.57 
 
 
190 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3231  hypothetical protein  34.19 
 
 
170 aa  99.4  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  40.52 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1433  protein of unknown function DUF820  32.61 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2809  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3291  protein of unknown function DUF820  30.22 
 
 
195 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.491293  normal  0.294877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  35.03 
 
 
210 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  42.04 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1855  protein of unknown function DUF820  30.34 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1881  protein of unknown function DUF820  30.34 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2695  protein of unknown function DUF820  29.35 
 
 
181 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4739  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3408  protein of unknown function DUF820  29.35 
 
 
181 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.393779  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2906  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0546574  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  36.31 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2740  hypothetical protein  35.95 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2204  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.171088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  25.41 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  34.85 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  32.54 
 
 
223 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  35.33 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  31.55 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  31.55 
 
 
203 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  30.64 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  32.4 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
218 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  30.72 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2742  protein of unknown function DUF820  41.51 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  29.76 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  33.58 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  26.44 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  24.28 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1366  hypothetical protein  48.57 
 
 
60 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  27.52 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  27.04 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  34.01 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  27.03 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  30.13 
 
 
227 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  28.4 
 
 
218 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
186 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2863  protein of unknown function DUF820  25.81 
 
 
203 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000118606  decreased coverage  0.0000938837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3258  protein of unknown function DUF820  25.81 
 
 
203 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  26.74 
 
 
192 aa  44.7  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  27.33 
 
 
193 aa  44.7  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  32.3 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  32.82 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5007  protein of unknown function DUF820  41.51 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0094  hypothetical protein  24.6 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000049462  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1625  hypothetical protein  39.24 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  26.53 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  27.08 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5058  protein of unknown function DUF820  29.1 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180114 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5520  protein of unknown function DUF820  27.14 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  26.85 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  25.85 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  31.28 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  30.5 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  22.87 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1018  protein of unknown function DUF820  30.83 
 
 
309 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.670173  normal  0.130086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  32.05 
 
 
201 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3734  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
223 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0954  protein of unknown function DUF820  31.15 
 
 
211 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  24.22 
 
 
241 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  31.62 
 
 
200 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  27.71 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  25 
 
 
182 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  27.89 
 
 
184 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>