20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0090 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0090  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 261 aa  507  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  24.64 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  25.42 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  27.32 
 
 		 279 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1400  PspA/IM30 family protein  28.16 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  26.92 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  23.92 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  28.89 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  26.28 
 
 		 258 aa  45.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1765  phage shock protein A, PspA  27.42 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.900566  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1358  phage shock protein A, PspA  27.09 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394632  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  26.44 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  24.71 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  24.84 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  25.13 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  26.04 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  29.55 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0429  phage shock protein A, PspA  25.76 
 
 		 272 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  25.55 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2279  phage shock protein A, PspA  26.39 
 
 		 295 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>