More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4132 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 257 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  95.72 
 
 		 257 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  63.14 
 
 		 255 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  63.07 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  63.07 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  51.07 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  51.28 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  51.29 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  47.5 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  49.78 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  47.64 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 240 aa  191  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  49.14 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  44.88 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  37.71 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  39.57 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  40 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  33.91 
 
 		 232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6056  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00777479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  38.3 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5851  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  38.72 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>