More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2974 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  88.64 
 
 
484 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
484 aa  985    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  63.58 
 
 
492 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.61 
 
 
495 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  50.61 
 
 
496 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.66 
 
 
465 aa  422  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.73 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  48.74 
 
 
474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.69 
 
 
485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.93 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.68 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.45 
 
 
493 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.38 
 
 
476 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.43 
 
 
479 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.35 
 
 
485 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.17 
 
 
493 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  49.34 
 
 
485 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.35 
 
 
485 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  47.65 
 
 
477 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.34 
 
 
490 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.97 
 
 
491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  48.72 
 
 
299 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5910  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.78 
 
 
220 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.12 
 
 
206 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.91 
 
 
260 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.02 
 
 
213 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.669863  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  32.53 
 
 
507 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.15 
 
 
225 aa  217  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237053  normal  0.0854342 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4407  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.44 
 
 
213 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.380012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3335  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.17 
 
 
211 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0920628 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.44 
 
 
213 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.23 
 
 
428 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.73 
 
 
224 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  40.38 
 
 
265 aa  203  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.6 
 
 
217 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  39.08 
 
 
264 aa  202  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.38 
 
 
247 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.24 
 
 
224 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.85 
 
 
202 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4300  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.69 
 
 
207 aa  192  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.49 
 
 
546 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.8 
 
 
244 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.02 
 
 
224 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.95 
 
 
209 aa  187  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.62 
 
 
214 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.76 
 
 
237 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.61 
 
 
300 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  48.11 
 
 
235 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.38 
 
 
217 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.65 
 
 
217 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.25 
 
 
223 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  52.17 
 
 
218 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.75 
 
 
223 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  52.17 
 
 
218 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.74 
 
 
229 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.69 
 
 
223 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.69 
 
 
223 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.74 
 
 
230 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.74 
 
 
230 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  52.17 
 
 
218 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0522  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.35 
 
 
208 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.78 
 
 
217 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0118  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.22 
 
 
217 aa  163  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.5 
 
 
219 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.75 
 
 
207 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12930  uracil-DNA glycosylase, family 4  47.8 
 
 
211 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1521  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.16 
 
 
229 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  38.76 
 
 
295 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.79 
 
 
216 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8784  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.81 
 
 
222 aa  146  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  36.93 
 
 
279 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.15 
 
 
279 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3623  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.63 
 
 
216 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.91 
 
 
245 aa  139  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  33.47 
 
 
279 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.86 
 
 
206 aa  136  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.27 
 
 
205 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  32.26 
 
 
279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.27 
 
 
210 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.52 
 
 
243 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.42 
 
 
264 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.69 
 
 
205 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.27 
 
 
341 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.69 
 
 
358 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  34.43 
 
 
282 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  40.49 
 
 
213 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.32 
 
 
193 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.32 
 
 
193 aa  124  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.62 
 
 
342 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.93 
 
 
276 aa  124  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.97 
 
 
186 aa  123  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.41 
 
 
201 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.1 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.1 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.69 
 
 
207 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.09 
 
 
209 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  39.53 
 
 
210 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.33 
 
 
317 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  32.27 
 
 
278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.23 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>