55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0088 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  92.89 
 
 
239 aa  427  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  54.58 
 
 
240 aa  244  7e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  52.56 
 
 
238 aa  239  3e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  44.02 
 
 
236 aa  175  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  31.06 
 
 
244 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  33.05 
 
 
243 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  33.05 
 
 
243 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  31.33 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  30.42 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  27.88 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  30.91 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  31.62 
 
 
242 aa  83.6  2e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  32.61 
 
 
233 aa  82.8  5e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  33.9 
 
 
241 aa  81.6  1e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  30.45 
 
 
249 aa  80.1  3e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  28.07 
 
 
294 aa  79.7  4e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  32.5 
 
 
240 aa  79.3  5e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  31.7 
 
 
229 aa  78.6  8e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  31.6 
 
 
239 aa  76.6  3e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  31.6 
 
 
239 aa  76.6  3e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  30.77 
 
 
235 aa  74.7  1e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  27.09 
 
 
260 aa  74.3  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  32.61 
 
 
230 aa  71.2  1e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  28.69 
 
 
248 aa  70.5  2e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  29.07 
 
 
235 aa  70.1  3e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  30.74 
 
 
231 aa  70.1  3e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  30.04 
 
 
232 aa  69.7  3e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  29.07 
 
 
243 aa  69.3  5e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  32.02 
 
 
239 aa  69.3  5e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  24.9 
 
 
260 aa  68.9  7e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  30.09 
 
 
234 aa  67.4  2e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  29.26 
 
 
227 aa  66.6  3e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  26.96 
 
 
315 aa  65.9  6e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  31.7 
 
 
234 aa  65.1  9e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  26.21 
 
 
260 aa  62.8  5e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  32.37 
 
 
258 aa  62  9e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  25.31 
 
 
254 aa  61.6  1e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  26.99 
 
 
237 aa  59.3  5e-08  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  37.38 
 
 
259 aa  59.3  5e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  36.45 
 
 
259 aa  57  3e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  39.32 
 
 
299 aa  56.6  3e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  27.07 
 
 
237 aa  57  3e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  38.46 
 
 
302 aa  54.7  1e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  25.31 
 
 
245 aa  54.7  1e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  26.78 
 
 
242 aa  53.1  4e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  29.44 
 
 
244 aa  53.1  4e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  27.65 
 
 
233 aa  52.8  5e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  24.9 
 
 
250 aa  52.4  7e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  33.93 
 
 
328 aa  50.1  3e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  36.71 
 
 
696 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  26.73 
 
 
230 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  22.4 
 
 
234 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  34.23 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>