292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0023 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0023  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00721211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2656  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  62.5 
 
 
206 aa  261  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129409  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4073  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.56 
 
 
202 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5175  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.5 
 
 
207 aa  163  2e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.79 
 
 
221 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364568  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4351  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.69 
 
 
224 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3955  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.46 
 
 
208 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0529615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3076  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.58 
 
 
204 aa  146  2e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3273  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.91 
 
 
206 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3438  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.94 
 
 
206 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4071  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
208 aa  131  1e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.184072  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3958  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
208 aa  131  1e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506419  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.62 
 
 
207 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.89 
 
 
200 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.97 
 
 
202 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  34.88 
 
 
208 aa  111  8e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1117  acyl carrier protein phosphodiesterase  33.71 
 
 
216 aa  110  2e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.3 
 
 
208 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.3 
 
 
208 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1692  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 
200 aa  109  4e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.83 
 
 
207 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  2.37921e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.9 
 
 
199 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  31.64 
 
 
199 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.68 
 
 
198 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3322  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.84 
 
 
203 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.635912  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 
198 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.64 
 
 
199 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.39 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1488  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.914083  normal  0.385532 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.2 
 
 
199 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2008  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.49 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.4 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.25 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.9 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.25 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.68 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.77 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.07 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  30.68 
 
 
198 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.28 
 
 
212 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.07 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  8.9212e-06  hitchhiker  7.0742e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  33.33 
 
 
192 aa  94.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.94 
 
 
204 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.68 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.11 
 
 
198 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.85 
 
 
202 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.75 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0245  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.84 
 
 
206 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.07 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  32.22 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.11 
 
 
198 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.52 
 
 
209 aa  92  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  32.94 
 
 
197 aa  92  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.18 
 
 
196 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3728  putative acyl carrier protein phosphodiesterase  31.18 
 
 
196 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3049  azoreductase type 1 family protein  29.78 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.053598  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  30.56 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.26863e-05  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.84 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.94 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.55 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.94 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  29.55 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  31.66 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  6.41081e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  29.55 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7443  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  31.46 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  29.55 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  29.55 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  29.55 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  30 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  30 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  31.09 
 
 
208 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  31.16 
 
 
198 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  31.16 
 
 
198 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.73737e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  30.39 
 
 
202 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  28.7 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  27.81 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.27 
 
 
202 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.64 
 
 
202 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.6 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4167  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.57 
 
 
208 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.46 
 
 
232 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0768  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.94 
 
 
197 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  29.44 
 
 
202 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  33.73 
 
 
182 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  32.54 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.17 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  29.21 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.95 
 
 
191 aa  85.1  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.1 
 
 
193 aa  85.1  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.44 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  29.44 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  30.15 
 
 
198 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.59762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  29.74 
 
 
202 aa  84.7  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  3.9255e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>