More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0009 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  100 
 
 
314 aa  641  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  95.22 
 
 
321 aa  587  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  78.03 
 
 
314 aa  493  1e-138  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1602e-07 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0448  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  76.43 
 
 
314 aa  468  1e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  68.47 
 
 
315 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  66.56 
 
 
313 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  66.56 
 
 
313 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  68.06 
 
 
318 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  66.56 
 
 
311 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  64.95 
 
 
313 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  64.63 
 
 
311 aa  417  1e-115  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  63.34 
 
 
332 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  63.34 
 
 
332 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  64.29 
 
 
315 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  50.32 
 
 
329 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  50.32 
 
 
350 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.24 
 
 
341 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  48.24 
 
 
341 aa  309  3e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0832  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  47.08 
 
 
313 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  47.4 
 
 
342 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0386  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.16 
 
 
357 aa  306  4e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4624  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.48 
 
 
350 aa  306  4e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5150  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  50.16 
 
 
350 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  52.43 
 
 
309 aa  303  3e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1962  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  47.74 
 
 
335 aa  302  5e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00495918  normal  0.0351342 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5263  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  49.2 
 
 
350 aa  301  8e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  49.2 
 
 
350 aa  301  8e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  49.52 
 
 
350 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  47.08 
 
 
333 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  46.43 
 
 
333 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  46.43 
 
 
322 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  47.42 
 
 
351 aa  286  3e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  48.61 
 
 
323 aa  283  2e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3178  ribonucleoside hydrolase 1  47.57 
 
 
318 aa  268  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  45.02 
 
 
311 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  47.08 
 
 
318 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.63 
 
 
322 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0018  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  45.66 
 
 
335 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  47.9 
 
 
311 aa  262  5e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  47.08 
 
 
318 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  47.9 
 
 
311 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  47.9 
 
 
311 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  46.75 
 
 
318 aa  261  9e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  47.57 
 
 
311 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  47.57 
 
 
311 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  44.92 
 
 
310 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0647  ribonucleoside hydrolase 1  46.45 
 
 
318 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  47.57 
 
 
311 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  47.57 
 
 
311 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3476  ribonucleoside hydrolase 1  46.45 
 
 
318 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0940  ribonucleoside hydrolase 1  46.6 
 
 
311 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.019412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  47.57 
 
 
311 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  47.57 
 
 
311 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0811  ribonucleoside hydrolase 1  47.25 
 
 
318 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  46.75 
 
 
318 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3306  ribonucleoside hydrolase 1  46.45 
 
 
318 aa  260  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  47.57 
 
 
311 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  47.25 
 
 
311 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  44.19 
 
 
314 aa  258  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  47.25 
 
 
311 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  47.27 
 
 
313 aa  259  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  44.77 
 
 
310 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  46.93 
 
 
311 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  45.39 
 
 
322 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  45.66 
 
 
355 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.41 
 
 
317 aa  254  1e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  46.6 
 
 
311 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  47.08 
 
 
312 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  44.69 
 
 
356 aa  252  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  45.05 
 
 
316 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  43.69 
 
 
310 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  43.61 
 
 
308 aa  249  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0697  ribonucleoside hydrolase 1  43.23 
 
 
335 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0017  Ribosylpyrimidine nucleosidase  43.45 
 
 
317 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  43.09 
 
 
312 aa  244  2e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  44.41 
 
 
312 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  43.18 
 
 
316 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  43.61 
 
 
313 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  43.61 
 
 
313 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  43.61 
 
 
313 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  43.61 
 
 
313 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.61 
 
 
313 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1443  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  44.55 
 
 
317 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  43.28 
 
 
313 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  43.28 
 
 
313 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  43.28 
 
 
313 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  44.19 
 
 
310 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  43.04 
 
 
316 aa  234  1e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  42.68 
 
 
313 aa  234  2e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2617  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  42.36 
 
 
322 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.82375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  40.78 
 
 
314 aa  233  4e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  44.69 
 
 
313 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  41.42 
 
 
312 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1981  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.97 
 
 
313 aa  229  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.842213  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  41.23 
 
 
311 aa  222  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  41.23 
 
 
311 aa  222  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3224  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  41.75 
 
 
319 aa  221  1e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00529527  normal  0.234301 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3659  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  39.4 
 
 
313 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.121445  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.44 
 
 
341 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.24 
 
 
338 aa  196  5e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>