215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3014 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  295  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  82.73 
 
 		 140 aa  249  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  80.58 
 
 		 140 aa  246  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  75.54 
 
 		 140 aa  228  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  72.66 
 
 		 139 aa  224  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  68.35 
 
 		 156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  62.22 
 
 		 147 aa  201  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  50.78 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  44.7 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  48.09 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 146 aa  136  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 146 aa  136  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  49.6 
 
 		 134 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  46.09 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  42.36 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  45.31 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  45.31 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  45.31 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  45.31 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  45.31 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  45.31 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  43.51 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  54.37 
 
 		 213 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  32.06 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  31.3 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  34.09 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  31.06 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  28.57 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  33.06 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  32.26 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.79 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  28.23 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  26.06 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  27.42 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  24.09 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  26.89 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  28.68 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  25.18 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  22.83 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  24.64 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.52 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  65.62 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  30.12 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  29.87 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  23.13 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  33.71 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>