More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1938 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  67.83 
 
 		 470 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  74.4 
 
 		 460 aa  721    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  65.5 
 
 		 487 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  72.87 
 
 		 460 aa  708    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  73.74 
 
 		 460 aa  723    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  77.78 
 
 		 468 aa  756    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 465 aa  955    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  73.74 
 
 		 460 aa  723    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  76.69 
 
 		 462 aa  744    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  66.81 
 
 		 476 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  75.05 
 
 		 460 aa  728    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  57.4 
 
 		 473 aa  557  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  53.07 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  54.92 
 
 		 483 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  54.92 
 
 		 481 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  54.7 
 
 		 481 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  54.92 
 
 		 483 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  54.7 
 
 		 483 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  54.49 
 
 		 483 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  54.7 
 
 		 483 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  54.27 
 
 		 481 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  52.3 
 
 		 463 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  51.51 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.65 
 
 		 478 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  52.02 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  51.1 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  50.67 
 
 		 494 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  49.25 
 
 		 510 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.03 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.79 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  50.88 
 
 		 460 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  50.88 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  50.45 
 
 		 494 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  49.89 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  50.22 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  50.88 
 
 		 460 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  50.54 
 
 		 460 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  50.98 
 
 		 460 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  50.54 
 
 		 460 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  50.44 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.8 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  50.66 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  50.44 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  49.12 
 
 		 461 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  49.56 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  47.46 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  47.9 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  47.05 
 
 		 460 aa  445  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  49.34 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0042  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  48.79 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  45.27 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  48.8 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  47.37 
 
 		 470 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  46.14 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  48.46 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  48.12 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  46.36 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  49.02 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3100  coproporphyrinogen III oxidase  46.61 
 
 		 469 aa  435  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  47.9 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  48.58 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0096  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  48 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.15 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  47.24 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0090  coproporphyrinogen III oxidase  45.25 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  48.67 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0053  coproporphyrinogen III oxidase  44.81 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.59946  normal  0.060899 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.96 
 
 		 463 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  47.81 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.96 
 
 		 463 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  45.92 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  46.12 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  47.02 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  48.23 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  48.23 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  47.81 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>