More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3110 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 366 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  89.89 
 
 		 366 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  78.06 
 
 		 374 aa  567  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  77.87 
 
 		 374 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  77.22 
 
 		 374 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  68.09 
 
 		 356 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  67.42 
 
 		 356 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  67.53 
 
 		 356 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  66.86 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  67.73 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 364 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  68.6 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  68.6 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  67.73 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  68.9 
 
 		 356 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  68.6 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  68.6 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  67.73 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  68.6 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  67.73 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  68.6 
 
 		 356 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  68.31 
 
 		 356 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  67.15 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  59.27 
 
 		 363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  55.49 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  56.16 
 
 		 365 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  55.92 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  56.3 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  57.47 
 
 		 375 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  57.38 
 
 		 368 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  53.07 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  57.66 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  54.82 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  54.52 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  53.06 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  53.17 
 
 		 396 aa  347  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  48.33 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  50.83 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  49.58 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  47.08 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  51.14 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  51.14 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 		 351 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  38.16 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  33.98 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  36.93 
 
 		 360 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 		 371 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  33.88 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  34.81 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  31.43 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.86 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  37.58 
 
 		 374 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  37.39 
 
 		 363 aa  189  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.79 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  36.68 
 
 		 370 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  35.82 
 
 		 363 aa  189  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 348 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  35.76 
 
 		 352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  35.26 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  36.64 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  32.95 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.31 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  37.09 
 
 		 369 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  36.04 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  37.67 
 
 		 362 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  34.73 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  31.83 
 
 		 350 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  38.83 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  30.68 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  33.69 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  39.17 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  29.72 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  36.67 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  31.36 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  36.99 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  36.07 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  34.51 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 		 357 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  37.5 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0323  aminotransferase class I and II  37.54 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  36.83 
 
 		 362 aa  162  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  29.51 
 
 		 356 aa  162  9e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0250  histidinol-phosphate aminotransferase  28.86 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.941413  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22000  histidinol-phosphate aminotransferase  37.8 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  36.73 
 
 		 371 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  37.94 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  31.72 
 
 		 355 aa  159  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0908  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284231 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  29.89 
 
 		 368 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  35.67 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  31.05 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  29.36 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  33.92 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  31.04 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>