More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3648 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
738 aa  1504    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
768 aa  200  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
753 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
660 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
1177 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
1177 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  35.95 
 
 
336 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  34.32 
 
 
253 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
322 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
1032 aa  127  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 
260 aa  124  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
334 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
261 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
655 aa  111  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
278 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
321 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
398 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
413 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
305 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 
268 aa  107  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  32.84 
 
 
773 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
411 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
756 aa  98.2  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
314 aa  98.2  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
412 aa  98.2  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.92 
 
 
326 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
318 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.75 
 
 
642 aa  95.5  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
318 aa  94.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
308 aa  94.4  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0494  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
674 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
357 aa  93.6  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.51 
 
 
326 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
330 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
812 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
373 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.51 
 
 
326 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
326 aa  92.4  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
316 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
447 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.46 
 
 
295 aa  91.3  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
316 aa  91.3  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
307 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.71 
 
 
326 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
361 aa  90.9  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
293 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
397 aa  89  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
386 aa  89  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
349 aa  88.2  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
333 aa  87.8  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
517 aa  87.8  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  23.73 
 
 
272 aa  87.8  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
777 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11660  glycosyl transferase  29.91 
 
 
287 aa  87  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  21.58 
 
 
740 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
380 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
310 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
230 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  34.51 
 
 
325 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
253 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30.36 
 
 
255 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
261 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
305 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.45 
 
 
253 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
544 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 
333 aa  82  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
300 aa  82  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  37.37 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  37.37 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.37 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.37 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.37 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  42.42 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
581 aa  81.3  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.37 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  41.41 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
1476 aa  80.5  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  42.42 
 
 
344 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
345 aa  80.5  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
262 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
727 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.96 
 
 
299 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  33 
 
 
319 aa  79.7  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
344 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  35.51 
 
 
325 aa  79  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  41.41 
 
 
344 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
235 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  41.41 
 
 
344 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>